博客园的第一篇随笔

最新推荐文章于 2021-10-09 11:28:47 发布
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原文链接：http://www.cnblogs.com/yunchispk/p/10960802.html
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学计算机这么久了，也在网上的博客找过了这么久的教程，自己也开过独立博客捣鼓过，终于把之前的决定转成了实际行动——在博客园上开通博客记录自己专业方面的学习心路历程，和园上的朋友多加交流并以此获得专业技能的巩固和提升。

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weixin_34242658
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blast | diamond 输出结果选择和解析 | 比对
weixin_34032792的博客
03-19 3922
之前的文章：构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时，需要指定out format。 常见的网页版blast结果可以参照：Blast结果的详细解析 *** Formatting options -outfmt <String> alignm...
第一次在博客园写随笔
weixin_30466953的博客
12-09 419
接触博客园是老师推荐的，在大二的时候老师说，你们以后有什么不懂要查什么资料可以去博客园。以后很常的一段时间我都在博客园上找资料，学习学习不断学习。看到了牛人们肆意的发文章，看到了大侠点评着某某的技术，某某的文章，我受益匪浅。我也想写随笔了，但是我认为这是一个神圣的地方，不能发垃圾文章，所以很长一段时间我都只是在这里看别人的文章。今天我要写文章了，我马上毕业了，技术虽然不好，但是我真的想和大家分享一...
博客园的随笔、文章、日志
weixin_30482383的博客
09-21 651
随笔：所有人在博客中都可以找到 文章：其他人在博客中找不到，可以通过url访问 日记：其他人通过url也看不到 转载于:https://www.cnblogs.com/dreamer-lin/p/11563481.html...
特定物种分类NR子库的建立
v8888657的博客
05-21 1530
1、NR数据库下载 aspera 软件的下载跟使用后续补充 #数据文件下载 ascp -T -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh --host=ftp.ncbi.nih.gov --user=anonftp --mode=recv /blast/db/FASTA/nr.gz ./ ascp -T -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh --host=ftp.ncbi.nih....
添加 index mysql
baiyangfu的专栏
08-20 949
1.添加PRIMARY KEY（主键索引） mysql>ALTER TABLE `table_name` ADD PRIMARY KEY ( `column` ) 2.添加UNIQUE(唯一索引) mysql>ALTER TABLE `table_name` ADD UNIQUE ( `column` ) 3.添加INDEX(普通索引) mysql>ALTER TABLE `ta
博客园openlivewriter
03-18
Open Live Writer是由Windows Live WriterWriter更名而来，是由微软推出的一款能够免费使用的博客写作软件，主要为用户提供博客在线撰写和编辑功能
博客园CnBlogs自定义博客样式分享
09-22
博客园CnBlogs是一个知名的中文IT技术博客平台，它允许用户创建个人博客来分享技术知识和经验。本文主要讨论如何自定义博客样式，以创建一个简洁、大方且具有蓝色基调的博客界面。 首先，自定义博客样式通常涉及到...
如何利用http协议发布博客园博文评论
12-18
先给大家介绍下实现原理： 给博文提交评论的实质就是通过http协议服务器发送一个post请求。在发布评论前，我们需要做什么...　为了完成本次测试，我又注册了一个博客园小号(DeanHuangChopper)，登录博客园后，打开我博
python3实现暴力穷举博客园密码
12-25
比如打开这个博文，会显示一个密码输入框：http://www.cnblogs.com/post/readauth?url=/muer/archive/2011/11/27/factualism.html 我之前没有写过这样的程序，也没有看过别人写这类功能的代码，就按我自己
博客园css样式 coffee.css
10-19
博客园样式
比对软件Blast，Blast+，Diamond如何选
qq_36608036的博客
12-02 2808
比对软件Blast，Blast+，Diamond比较 Blast （1）格式化数据库 formatdb -i db.seq -p T -o T -l logfile 主要参数： -i 输入需要格式化的源数据库名称 -p 文件类型，是核苷酸序列数据库（F - nucleotide）/蛋白质序列数据库（T – protein），default = T -a 输入数据库的格式是否为ASN.1/FAST...
构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb...
weixin_33806300的博客
02-21 1万+
参考链接： FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库？ 下载blast：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解BLAST Databases：BLAST FTP Site   如何下载NCBI blast数据库？ NCBI提供了一个非常智能化的脚本update_blastdb.pl来自动下载所有...
[文档] TDDL和Diamond的使用(二):Diamond
LzwGlory的专栏
04-27 1738
一， Diamond编译 　　Diamond的代码库地址为：http://code.taobao.org/svn/diamond/trunk;当前版本是r20，但是与TDDL匹配的版本是r16，因此我们在check时需要指定这个版本。 　　1)　获取代码：svn co http://code.taobao.org/svn/diamond/trunk -r r16 　　获取
windows平台本地化blast2.8.0（构建NR本地数据库，批量生成pssm打分矩阵）
阿斯达克
03-28 4906
1、下载blast+程序 2、下载nr数据库，也可选择下载nt数据库或其他数据库，操作一样。 3、修改环境变量并本地化blast程序 4、将自己的序列与数据库文件对比，生成pssm矩阵 5、通过python程序批量生成pssm矩阵
如何在博客园中添加新随笔以及随笔参考格式
dingouwei0642的博客
03-24 1049
针对同学们不熟悉如何在博客园中添加新随笔，请进入链接后学习一下。 学生发布随笔的格式参考： 1、每位同学撰写随笔包括的内容为： （1））请将pta作业编程题目的解题思路和调试过程记录在自己的博客（写新的随笔）中，每道题目的具体格式如下： 题目6-1 计算两数的和与差1 设计思路(1)主要描述题目算法。可以用文字描述（不允许使用伪代码），如：第一步：###第二...
DIAMOND: 超快的蛋白序列比对软件
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08-28 2万+
相见恨晚，还好遇到了它 今天用BLASTX将我的转录本序列在UniProt蛋白数据库(700w条序列)中搜索，80个线程，过了1小时大概就分析1000条吧。实在是有点慢，于是我想到之前耳闻的DIAMOND，据说速度非常快，于是我测试了下。没想到，这工具居然那么快。 根据DIAMOND介绍，它有以下特点 比BLAST快500到20,000倍 长序列的移框联配分析(framesh...
NR数据库的物种注释
songyi10的博客
10-09 1万+
NR数据库的物种注释 1.创建NR子库 为什么要创建nr或nt数据库的子库，因为这两个库数据量巨大，若只专注某个领域而非全部，则在对自身领域进行注释时就会耗费大量时间，为了节省时间，就需要在原来nr/nt数据库的基础上构建相对的子库。 构建方法如下： 方法一：从NCBI官网下载相应物种的Accession ID 在2017年之后的nr/nt数据库变成不再支持gi号搜索的。所以我们不可以根据gi号来分离并构建对应的子库，那么我们就需要查看新版本的nr/nt库的序列的id特征，发现他们变成了accessio
博客园的 “随笔、文章、日记”有什么区别？
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12-17 6729
博客园的 “随笔、文章、日记”有什么区别？生成的url有区别“p/articles/diary”，并且日记不公开
NR 数据库简介
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目前有很多的数据库都存储了蛋白序列，比如NCBI Refseq, protein, swissprot 等，在各个数据库之间，或者是在某个数据库中，蛋白序列有大量冗余；为了方便使用，ncbi 构建了nr 库， 全称是 RefSeq non-redundant proteins； Non-redundant protein sequences from GenPept,  Swissprot, PI...
c++笔试题库 博客园
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10-10
博客园是一个知名的中文博客平台，也是中国最大的独立博客社区之一。它为广大用户提供了一个方便的分享和交流的平台。其中，c 笔试题库是博客园上一个针对 C 语言编程的题库。 该题库主要面向对 C 语言有一定基础的...

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