本文的主要内容分为
1、下载blast+程序
2、下载nr数据库,也可选择下载nt数据库或其他数据库,操作一样。
3、修改环境变量并本地化blast程序
4、将自己的序列与数据库文件对比,生成pssm矩阵
5、通过python程序批量生成pssm矩阵
一、下载blast+程序 (#mark1)
从 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/下载blast+程序
或者进入NCBI输入blast进入界面
下载到非系统盘,如E:\blast 并新建文件夹db,后面放nr数据库使用。