质控工具之cutadapt的使用方法

cutadapt

参考：用cutadapt软件来对双端测序数据去除接头

 

fastqc可以用于检测，检测出来了怎么办？

看了几篇高水平文章，有不少再用cutadapt，虽然有时候数据真的不错，但是还是要质控一下，修剪一下。

 

cutadapt -a ADAPTER_FWD -A ADAPTER_REV -o out.1.fastq -p out.2.fastq reads.1.fastq reads.2.fastq

　　

 

待续~