idea创建包怎么让包分层_R包table1创建网页格式的描述性统计表Table 1

• 介绍

• 例1

• 例2

• 使用缩写代码指定自定义renderer

• 显示不同变量的不同统计信息

• 改变表的外观

  • • 使用内置的样式

• p-values列

• 表格的转置

介绍

在流行病学和其相关领域期刊上的标准做法是，用第一个表格(即Table 1)展示按暴露程度分层的研究人群的基线特征的描述性统计。使用R包table1去生成Table 1相当的easy。输出格式为HTML，其优点是易于复制到Word文档中。这个包允许相当大的灵活性来定制表的内容和外观，但是这需要更多的编程和CSS知识。

例1

使用boot包中的melanoma数据集来进行展示，数据集的变量定义和具体描述利用?melanoma进行查看，melanoma数据框有205行，7列。

library(table1) library(boot) melanoma2  # Factor the basic variables that# we're interested inmelanoma2$status   factor(melanoma2$status,          levels=c(2,1,3),         labels=c("Alive", # Reference"Melanoma death", "Non-melanoma death"))

先来个简单的操作试试感觉：

table1(~ factor(sex) + age + factor(ulcer) + thickness | status, data=melanoma2)

注意，table1包使用了一个熟悉的公式接口，各变量之间用 + 分隔，条件符号 | 的右边为分层变量，参数data指定使用的数据集。

变量和分类的标签可能不适合用来描述结果，可以给分类变量指定标签，给特定的连续变量指定单位。

melanoma2$sex   factor(melanoma2$sex, levels=c(1,0),         labels=c("Male", "Female")) melanoma2$ulcer   factor(melanoma2$ulcer, levels=c(0,1),         labels=c("Absent", "Present"))label(melanoma2$sex)       "Sex"label(melanoma2$age)       "Age"label(melanoma2$ulcer)     "Ulceration"label(melanoma2$thickness) "Thickness"units(melanoma2$age)       "years"units(melanoma2$thickness) "mm"table1(~ sex + age + ulcer + thickness | status, data=melanoma2, overall="Total")

这看起来好了很多，但是还可以做一些调整，如：调整Total列至最左侧、两个“Death”层(Melanoma Death和Non-melanoma Death)应该在一个共同的标题下分组、修改连续变量(Age和Thickness)的展示形式 Means (SD)为 Means (&plusmn SD)、不输出默认的Median [Min, Max] 统计量、有效数字的修改等。这稍微有些复杂，一般的