spss分析qpcr数据_癌旁vs癌的成对组织标本做qPCR，该如何分析qPCR数据？

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我们曾经介绍过in vitro study中干预组(加药组)vs 对照组的qPCR的实验重复和数据分析，详见 原理易懂，结果难做——QPCR结果你会分析么？。即加药实验重复三次，进行pcr实验的每次设3个副孔，进行数据分析以探究加药对细胞的影响。对于同一种药物作用于同一种细胞相同的时间，理论上三次独立重复试验中药物所引起A基因mRNA水平的变化是确定的。

然而在肿瘤标本和癌旁标本的pcr实验中，因为不同个体之间的A基因mRNA水平是不一样的，所以不同个体之间不能算是实验重复，。那么应该如何进行统计作图呢？

现在有20对病人某肿瘤组织标本，每对组织有癌(T)和癌旁(N)两个组织，我们想看基因A的mRNA水平在癌和癌旁中是否有差异？ 实验设计及结果 对20对标本(40个组织)分别采用提取组织mRNA的方式，protocol可以在科研狗网站http://www.keyangou.com 中找到，然后逆转录成cDNA。 进行qPCR之后我们会得到如下结果(只展示了第一对和第二对标本组织，T1代表第一对的癌组织，N1代表第一对的癌旁组织)： 然后我们做完20对组织的qPCR之后，整理数据得到如下结果：