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我们曾经介绍过in vitro study中干预组(加药组)vs 对照组的qPCR的实验重复和数据分析,详见 原理易懂,结果难做——QPCR结果你会分析么?。即加药实验重复三次,进行pcr实验的每次设3个副孔,进行数据分析以探究加药对细胞的影响。对于同一种药物作用于同一种细胞相同的时间,理论上三次独立重复试验中药物所引起A基因mRNA水平的变化是确定的。
然而在肿瘤标本和癌旁标本的pcr实验中,因为不同个体之间的A基因mRNA水平是不一样的,所以不同个体之间不能算是实验重复,。那么应该如何进行统计作图呢?
现在有20对病人某肿瘤组织标本,每对组织有癌(T)和癌旁(N)两个组织,我们想看基因A的mRNA水平在癌和癌旁中是否有差异? 实验设计及结果 对20对标本(40个组织)分别采用提取组织mRNA的方式,protocol可以在科研狗网站http://www.keyangou.com 中找到,然后逆转录成cDNA。 进行qPCR之后我们会得到如下结果(只展示了第一对和第二对标本组织,T1代表第一对的癌组织,N1代表第一对的癌旁组织): 然后我们做完20对组织的qPCR之后,整理数据得到如下结果: