mirna富集分析_miRNA富集分析数据库

1. 写在前面

对于miRNA而言。其功能的预测基本都是通过其影响的基因来进行来讲总结的。随着关于miRNA的研究过多，目前也有了关于miRNA功能注释的数据库也越来越多。这样的话，基于这样的数据库来进行功能预测了。今天就给大家介绍一个可以做miRNA功能预测的数据库：miEAA(https://ccb-compute2.cs.uni-saarland.de/mieaa2/)

2. 富集分析操作

2.1 数据输入

对于数据库的操作。我们只需要点击: Run MiEAA即可进行分析。剩下的，基本上就是按照数据库指引选择合适的数据和合适的分析即可。具体操作步骤包括：

1。选择输入的miRNA的类型。由于miRNA形成的过程中，主要产生两种形态，前体和成熟体，所以我们在输入的时候首先第一步就是来区分数据miRNA的类型

2。选择富集分析的方式。之前在关于富集分析算法的介绍，我们之前提到过，目前主要还是分ORA以及GSEA(基因富集分析算法介绍)。同样的这个数据库也可以做ORA以及GSEA两种。

这里需要注意的是：对于ORA而言，我们输入的就是想要分析的miRNA即可。对于GSEA的分析，miRNA的输入前后是有一定顺序的。这个顺序可以是差异分析logFC的顺序也可以是相关分析的顺序等等。

3。选择物种以及输入想要分析的miRNA。这个数据库一个支持包括人类在内的10个物种的分析