这里开始记录如何导入mimiciv数据包,那个7g的mimic-iv-0.4.zip数据包解开后就是这样几个文件夹
还有几个包如cxr没放出来,最后一个文件应该是校验用的,一般可以不做校验。
ps:记得先将那3个脚本也放到和icu、core同级目录,一会儿就靠这几个sql文件来导数据了。注意里面的脚本是要根据目录以及表头修改的,我得去找个地方放这三个文件提供下载;[公众号下 输入:mimiciv 稍后我搞个自动回复送下载地址吧]
建议将解开的包更名迁移到 /volumes/postgre/mimiciv 便于操作;然后进入下面这个shell:
一通回车之后,别忘了中间有输入密码那个就是默认postgres的;
自此开始正式的内容:
postgres=# CREATE DATABASE mimic4 OWNER postgres; 建立mimic4的数据库,如果以前有请先drop删除;红色部分别输进去,下同;
postgres=# \c mimic4; 进入mimic4数据库;
mimic4=# CREATE SCHEMA mimiciv; 建立一个叫mimiciv的schema;
mimic4=# \i /Volumes/postgre/mimiciv/create_tables.sql; 先建个表们的骨架先 ;
mimic4=# \i /Volumes/postgre/mimiciv/load_data.sql; 开始导入数据
mimic4=# \i /Volumes/postgre/mimiciv/add_indexes.sql; 建索引提高效率
命令行自动操作,此处大约需要一天时间,耐心等待,不要以为宕机去重启;直到出现最下面那个提示。