Use python code to generate the lammps data file for the nanosphere model of the grafted polymer cha...

下面是用 Python 代码生成 nanosphere 模型的 LAMMPS 数据文件的示例：

``` import random

定义 nanosphere 的半径

radius = 10

定义聚合物链的长度

chain_length = 20

定义聚合物链的起始位置

chain_start = (0, 0, 0)

定义聚合物链每个单位的极性

polarity = 1

定义聚合物链的总质量

total_mass = 100

定义每个聚合物单位的质量

unit_mass = total_mass / chain_length

定义 LAMMPS 数据文件的头部

header = """ LAMMPS Data File for Nanosphere Grafted Polymer Chain

{} atoms {} bonds

1 atom types 1 bond types

0 {} xlo xhi 0 {} ylo yhi 0 {} zlo zhi

Masses

1 {}

Atoms

""".format(chain_length + 1, chain_length, radius2, radius2, radius*2, unit_mass)

定义聚合物单位的初始位置

positions = [chain_start]

随机生成聚合物链的位置

for i in range(chain_length): x = positions[-1][0] + random.uniform(-1, 1) y = positions[-1][1] + random.uniform(-1, 1) z = positions[-1][2] + random.uniform(-1, 1) positions.append((x, y, z))

生成 LAMMPS 数据文件的原子部分

atoms = "" for i, pos in enumerate(positions): atoms += "{} 1 {} {} {} {}\n".format(i+1, pos[0], pos[1], pos[2], polarity)

生成 LAMMPS 数据文件的键部分

bonds = "" for i in range(chain_length): bonds += "{} 1 {} {}\n".format(i+1, i+1, i+2)

将头部、原子部分、键部分拼接在一起，得到完整的 LAMMPS 数据文件

lammps_data = header +