gromacs 安装_报名gromacs实操课！赠送LAMMPS干货！

Gromacs实操课最后上车机会！还来得及哦！ 你想被其他同学落下一大截么？ 不想的话，就赶紧报名更具有可信度的科学指南针旗下指南针学院举办的gromacs课程吧！ 课程是针对 小白学员 专门打造的，5.18即将开课！ 另外，现在 报名gromacs课程 ，还有 lammps的干货赠送 哦！只能说： 太值啦！

课程介绍

本期课程从分子模拟的入门知识讲起，将分子模拟涉及的各种条件参数的设置等进行详细的讲述。

课程主要通过gromacs软件的操作使用，结合分子模拟中常见的计算   内容，包括常见的模拟内容、模拟体系、模拟条件等，以及各种常见   的热门模型的建立、常见物理量的计算等内容，将分子模拟的初级、中级知识，循序渐进地进行拆解讲授。

老师简介

刘老师，分子模拟工程师。从事分子动力学模拟研究近七年，在 JMCA、JPCC、Langmuir 等国际著名期刊发表过几十篇仿真模拟方面的论文，在生物模拟和材料模拟方面都具有丰富的知识和经验。进行过线下线上的培训百余次，具有丰富的模拟经验以及教学经验，可针对知识难点、学员易错点等进行深入浅出的讲解。

课程安排

部分课程内容预览

课程内容详情

目录	课程内容	节数
1 分子模拟入门理论	1.1 基本假设 1.2 主要算法介绍：最速下降法、共轭梯度法 1.3 积分步长的选取 1.4 温度和压力控制 1.5 周期性边界条件 1.6 分子动力学模拟流程	1节
2 GROMACS入门操作基础	2.1 Linux命令入门基础 2.2 GROMACS的win版linux版编译安装 2.3 GROMACS涉及的各种输入输出文件参数介绍 2.4 GROMACS力场介绍	(实操课：1.5节)
3 GROMACS入门建模	3.1 Packmol，GaussView，vmd等建模软件的使用 3.2 建立各种体系模型：混合模型、界面模型、球体模型等 3.3 小分子各种力场TOP文件的建立，x2top，prodrg，ATB，Itp，top的结构以及参数说明 3.4 如何修改力场参数	(实操课：1.5节)
4 GROMACS入门计算实例	4.1 纯相、多相混合体系模拟计算：冰、水、甲烷等；乙醇等极性溶剂 4.2 界面模拟计算：气液界面、固液界面、油水界面 4.3 物理场下的模拟计算：静电场、微波场、高斯脉冲场 4.4 石墨烯、纳米管的模拟	(实操课：2节)
5 GROMACS中级计算实例	5.1 蛋白体系、生物大分子建模仿真 5.2 蛋白配体复合物建模仿真 5.3 生物膜构建和模拟5.4 表面活性剂构建和模拟	(实操课：3节)
6 GROMACS分析指令	6.1 GROMACS初级分析工具运用：径向分布函数(RDF)、离子配位数、扩散系数、介电常数、RMSD分析、抽取性质数据、计算回转半径 6.2 各种能量性质计算：各个方向密度、压力、表面张力、势能 6.3 氢键相关性质计算：平均氢键个数、平均氢键寿命、氢键自相关函数 6.4 结构分布、四面体参数 6.5 计算键角和二面角的分布：用make_ndx建立索引 6.6 计算二维的平面或轴径向密度 6.7 空间分布函数的绘制 6.8 使用g_MMPBSA计算结合自由能	(实操课：2节)
7 使用AmberTools建立分子GAFF力场(力场的精确构建方法)		(实操课：1节)

课程说明

说明：

• 3.5折优惠名额：转发本文到朋友圈，集赞10个，可获得3.5折听课优惠；不集赞，课直接享受5折报名，仅需1650元可听课;

• 预存福利：预存活动所获得的模拟计算培训课3折优惠券，可以在此课程使用；

• 老客户福利：凡参与过量子化学、计算结果解读课程的同学，可直接享受3.5 折报名优惠，无需集赞，直享优惠；

• 小班授课，课堂容量100人，先报名先上课；

• 所有优惠不可同享，最终解释权为指南针学院所有。

报名直接添加下方小游师妹 微信 

联系学院小游师妹：18898886246(同微信)

学分子模拟，就上指南针学院，报名gromacs实操课！                                                                                                      

LAMMPS干货介绍：

干货包括LAMMPS培训课程录像及计算模板

具体课程内容包括：

1、介绍如何使用LAMMPS设置和运行一个MD仿真

2、讨论如何下载和安装LAMMPS，并更深入的探讨LAMMPS提供的各种软件包以及如何有效的使用

      

lammps干货领取方式

报名gromacs课程后，凭课程报名订单号，找小游师妹领取lammps干货！                                                           

小福利：

针对模拟计算我们有专门的沟通群，想进群的小伙伴加微信

17812574221

备注：模拟计算进群

群里可以和老师一起探讨问题，老师也会帮助解答问题的哦~

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