MIMIC数据库提取教程-提取某种疾病下的实验室指标

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我们在进行数据分析时，很多时候需要提取出患某种疾病的患者的实验室指标，比如患者的血气，血常规等指标。

小编今天以提取患“肺栓塞”患者的实验室指标为例子，教大家如何提取mimiciv数据库的实验室指标。

目录

01 提取指标

02 操作步骤

03 合并结果

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01 提取指标

小编本次要提取的指标是患有“肺栓塞”的患者的以下实验室指标：“血红蛋白”，“D二聚体”，“葡萄糖”。

提取的最终结果如下：

02 操作步骤

第一步，因为mimic中的疾病数据是根据icd编码查找的，所以我们需要先找出“肺栓塞”对应的icd编码，从下表可以看出肺栓塞的icd编码大部分都是以“415“开头的

第二步，我们需要根据icd编码从诊断表diagnoses_icd中查出患了“肺栓塞“的患者的信息，并根据患者分组，此处小编已经把所有患者都查出来了，患了“肺栓塞”的患者标志为1，没有患这个病的标志为0

第三步，查询实验室指标对应的itemId，这需要从字典表d_labitems中根据指标标签查询，小编这里只查询了“血红蛋白”的itmeId，我们查询的是血气中的血红蛋白，其他指标查询方法类似

第四步，从实验室指标表labevents查找实验室指标的信息，并根据患者分组

03 合并结果

小编现在已经分别查询出来了患了“肺栓塞”的病人，以及对应的实验室指标，最后需要把这些SQL语句合并后，才能输出在一张表格，其中使用了with子查询，分别把诊断数据跟实验室指标数据作为子查询，以下是完整的SQL解释。

为了方便大家的学习，小编已经把完整的SQL脚本整理好放在后台，如果需要本次教程的SQL脚本，关注公众号“科研收录”，后台回复“肺栓塞”即可获取脚本。