linux系统root安装,linux下安装R（非root权限）

在使用R时，很多人都是在登陆节点上装R包，但R很占内存，直接在登陆节点跑复杂程序，管理员该找你喝茶了。但是投递到计算节点又跑不了，真是头大。原因是计算节点的R又没装你要用的R包。有人会说，那在每个计算节点上装一遍不就行了，计算节点如果有20个，一个一个装不是啥大事，可又不止这一个包，来10个20个包，谁受得了。【所以要自己把R装在一个登陆节点和计算节点都可以访问到的地方，这样就可以了。大多数人都没有root权限，怎么装，看下面。】

R官网下载R，放在你能找到的地方。我下载的是R-3.5.3

第一步：tar -xzf  R-3.5.3.tar.gz #解压

cd R-3.5.3 #打开

./configure --prefix=/home/bin/R  #我是放在我的home/bin路径下的，这个可以自己放在喜欢的位置

第二步：一般 ./configure都会报错，此步主要是把这些错误都解决了

【报错1】configure: error: zlib library and headers are required

解决：自己百度下载zlib

tar -xzf zlib-1.2.11.tar.gz  #可能会有最新版

cd zlib-1.2.11

./configure --prefix=/home/bin/zlib-1.2.11

make

make install

【继续configure R】 ./configure --prefix=/home/bin/R --enable-R-shlib LDFLAGS="-L/$HOME/Programme/zlib-1.2.11/lib"  CPPFLAGS="-I/$HOME/Programme/zlib-1.2.11/include"

【报错2】configure: error: bzip2 library and headers are required

解决：自己百度下载bzip2(官网下不下来，可能是自己chun，就在百度某页面随便下了一个)

tar -xzf bzip2-1.0.6.tar.gz

cd bzip2-1.0.6

make

make install PREFIX=/home/bin/bzip2-1.0.6

make -f Makefile-libbz2_so

最后这步会有问题，网上说这么解决，一开始没解决，试了无数遍后奇迹般解决的。如果你们遇到也可以试试。多试几遍。

第一：设置环境变量：

vi    ~/.bashrc #添加下面的代码

export PATH=/home/bin/bzip2-1.0.6/bin:$PATH

export LD_LIBRARY_PATH=/home/bin/bzip2-1.0.6/lib:$LD_LIBRARY_PATH

export CFLAGS="-fPIC -I/home/bin/bzip2-1.0.6/include"

export LDFLAGS="-fPIC -L/home/bin/bzip2-1.0.6/lib"

:wq

source ~/.bashrc

第二：指定-fPIC编译：重新编译步骤：

cd bzip2-1.0.6

make CC='gcc -fPIC'

make install PREFIX=/home/bin/bzip2-1.0.6

make -f Makefile-libbz2_so //建立共享library,不会报错说明正确

【继续configure R】 ./configure --prefix=/home/bin/R --enable-R-shlib LDFLAGS="-L/home/bin/zlib-1.2.11/lib -L/home/bin/bzip2-1.0.6/lib"  CPPFLAGS="-I/$HOME/Programme/zlib-1.2.11/include -I/home/bin/bzip2-1.0.6/include"

【报错3】configure: error: "liblzma library and headers are required"

解决：自己百度下载 xz-5.2.4.tar.gz

tar -xzf xz-5.2.4.tar.gz

cd xz-5.2.4

./configure --prefix=/home/bin/xz-5.2.4

make

make install

【继续configure R】 ./configure --prefix=/home/bin/R --enable-R-shlib LDFLAGS="-L/home/bin/zlib-1.2.11/lib -L/home/bin/bzip2-1.0.6/lib -L/home/bin/xz-5.2.4/lib"  CPPFLAGS="-I/$HOME/Programme/zlib-1.2.11/include -I/home/bin/bzip2-1.0.6/include -I/home/bin/xz-5.2.4/include"

【报错4】configure: error: pcre >= 8.20 library and headers are required

解决：自己百度下载 pcre-8.43.tar.gz (千万不要错下载pcre2- 的版本)

tar -xzf pcre-8.43.tar.gz

cd pcre-8.43

./configure --prefix=/home/bin/pcre-8.43

make

make install

【继续configure R】 ./configure --prefix=/home/bin/R --enable-R-shlib LDFLAGS="-L/home/bin/zlib-1.2.11/lib -L/home/bin/bzip2-1.0.6/lib -L/home/bin/xz-5.2.4/lib -L/home/bin/pcre-8.43/lib"  CPPFLAGS="-I/$HOME/Programme/zlib-1.2.11/include -I/home/bin/bzip2-1.0.6/include -I/home/bin/xz-5.2.4/include -I/home/bin/pcre-8.43/include"

【报错5】configure: error: libcurl >= 7.22.0 library and headers are required with support for https

解决：自己百度下载curl-7.64.0.tar.gz

tar -xzf curl-7.64.0.tar.gz

cd curl-7.64.0

./configure --prefix=/home/bin/curl-7.64.0

make

make install

【继续configure R】 ./configure --prefix=/home/bin/R --enable-R-shlib LDFLAGS="-L/home/bin/zlib-1.2.11/lib -L/home/bin/bzip2-1.0.6/lib -L/home/bin/xz-5.2.4/lib -L/home/bin/pcre-8.43/lib -L/home/bin/curl-7.64.0/lib"  CPPFLAGS="-I/$HOME/Programme/zlib-1.2.11/include -I/home/bin/bzip2-1.0.6/include -I/home/bin/xz-5.2.4/include -I/home/bin/pcre-8.43/include -I/home/bin/curl-7.64.0/include"

这样configure就不会有错啦

第三步：make

【如果没有报错】make install 就装好了

【如果有报错】

报错1：报错内容包含libbz2.a，重复第二步的报错2解决方案，直到没有报错才可以，要不然会一直报错，无法make。

报错2：报错内容包含lzma、pcre，需要修改configue 内容，加-Wl,rpath

./configure --prefix=/home/bin/R --enable-R-shlib LDFLAGS="-L/home/bin/zlib-1.2.11/lib -L/home/bin/bzip2-1.0.6/lib -L/home/bin/xz-5.2.4/lib -L/home/bin/pcre-8.43/lib -L/home/bin/curl-7.64.0/lib -Wl,rpath=/home/bin/pcre-8.43/lib -Wl,rpath=/home/bin/xz-5.2.4/lib"  CPPFLAGS="-I/$HOME/Programme/zlib-1.2.11/include -I/home/bin/bzip2-1.0.6/include -I/home/bin/xz-5.2.4/include -I/home/bin/pcre-8.43/include -I/home/bin/curl-7.64.0/include"

接着make, make install

第四步：待所有的安装都成功后，把R 的路径写在bashrc里就可以了

参考链接：http://blog.sina.com.cn/s/blog_6aaea1760102x5ka.html

https://www.jianshu.com/p/edb234eed915