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原创 记一个问题libcairo2-dev : Depends

安装R包时候提示:No package 'cairo' found然后apt install libcairo2-dev提示有依赖安装依赖又提示版本不对解决版本,然后安装,装好了> install.packages('gdtools')No package 'cairo' foundUsing PKG_CFLAGS=Using PKG_LIBS=-lcairo -lfreetype-----------------------------[ ANTICONF ]--.

2022-03-19 21:27:24 1205

原创 AGS测序下游分析一条龙

转录组测序分析

2022-03-12 00:28:37 1017

原创 Bulk-RNA-seq流程——从测序数据到count文件(AGSdata)

RNA-seq通用流程(从原始测序数据到count文件):环境安装,软件安装,数据质控,数据过滤,序列比对,bam文件,count

2022-02-11 19:51:23 8958 1

原创 Ubuntu18.04安装R/Rstudio

# root sudo# install Rapt update -qqapt install --no-install-recommends software-properties-common dirmngrwget -qO- https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu/marutter_pubkey.asc | sudo tee -a /etc/apt/trusted.gpg.d/cran_ubuntu_key.ascadd-apt-repo.

2021-12-29 17:37:01 627

原创 Ubuntu18.04安装Aspera批量下载SRA数据

aspera高速下载SRA数据

2021-12-23 17:32:23 1764

原创 ubuntu18.04重装R

之前安装后的Rstudio一直报错Error in RStudioGD() : Shadow graphics device error: r error 4 (R code execution error)Warning message:In grDevices:::png("...******.......", : could not open connection to X11 display> capabilities() jpeg pn...

2021-12-08 00:43:21 1526

原创 创建Seurat对象

读取cellranger输出的10X数据文件并创建Seurat对象

2021-12-07 15:47:55 4870

原创 aggr报错解决

cellranger aggr解决cloupe.file和calledprocesserror

2021-12-02 14:47:05 765

原创 cellranger aggr

cellranger aggr运行

2021-12-02 13:55:36 1146

原创 count

cellranger count

2021-11-25 18:50:46 684

原创 服务器初配置

一、基本信息服务器规格16vCPUs | 128 GiB | m6.4xlarge.8 | Ubuntu 18.04 server 64地址116.63.173.172用户密码rootWyl822822cmd终端登录:ssh root@116.63.173.172PASSWORD#输入不显示,直接输入回车#如果出现ERROR提示ECDSA host key error,清除服务器缓存后,重新登录ssh-keygen -R 116.63.173.172挂载数...

2021-11-25 18:12:18 595

空空如也

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