sangerbox使用教程_SangerBox：一款好用的生物信息分析可视化工具

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很多医生在科研工作中需要用到一些分析工具，有一些是纯统计类的工具或方法，有一些也是计算机类的，但我们习惯把它们称作生物信息学方法。这背后蕴含一些数学原理，原理我们知道就行，会用就可以了。

小白我属于生物信息学专业道理都懂但是编程不太好的那类，我的课题没有经过太多锻炼(尴尬)，所以我更喜欢用工具 不论是本地的还是在线的。

我哈尔滨医科大学的同学研发了一款工具盒，里面涵盖了几十种生信分析常用的小模块，感觉非常适合我，这个工具盒使用方式非常友好，我觉得也很适合临床医生等初学者入门。

因为关系比较密切，所以我第一时间就拿到了内测版。不过到我写文章时已经开始公测了，下载地址在这了：https://shengxin.ren/softs/Sanger_V1.0.8.zip

目前工具的稳定性还不错，在后台挂着也不会出现之前一直断线的问题

有些朋友可能还不知道SangerBox(中文名：桑格助手)是什么，它的前身是生信人工具盒，是一款具有多种生物信息分析+可视化作图+便捷数据下载功能的工具，据说使用量达到了50多万人次。为广大医生和生物信息科研学者提供了极大的便利。但是之前的工具盒也存在一些bug，有一些是架构决定的，很难再去优化。所以我们决定重做工具盒，把之前想做但是实现不了的功能加了进来。  (这段话是我的朋友产品经理让加的。。)废话不说，上图

这个工具有一个问题要注意：就是在使用之初要先配置环境，因为它调用的是本地的R程序，一次配置，全程使用。

下面这一段是公司给我的，这个很重要

1、工具盒下载输入下面链接地址：

https://shengxin.ren/softs/Sanger_V1.0.8.zip，将下载好的压缩包解压，为了避免后续出现异常，此处建议解压缩路径不要出现特殊字符及中文字符。解压完成后双击SangerBox.exe，如下图1红圈圈部分：

图1

双击后界面如下图2，注意第一次登陆需要一小段时间读取，等下片刻即好。

图2

2、工具盒环配置

点开升级界面，如果所示，如果出现新版本，即可点击最新软件版本进行升级。

第一次使用工具盒用户需要注意图3中红圈和蓝圈标注位置。

图3

首先红色圆圈标注位置会自动读取系统内已经安装的JRE环境，没有安装JRE的用户可以打开下面网址进行选择相应版本进行安装

http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/jre8-downloads-2133155.html

注意记下安装路径，如果重启sangerbox没有自动读取相应路径，需要手动添加步骤如下图4所示，点击选择JAVA，弹出一个文件选择框，输入之前java安装目录，找到bin文件夹下面的java.exe读入即可，如图5所示。

图4

图5

图6

接下来处理Rscript，也就是图3中蓝色圈圈，刚开始打开是乱码，这里操作同样如图4，点开选择Rscript，找到R安装路径，选择bin目录下的Rscript.exe，如图6所示。

暂时不建议一键安装java和R，由于安装位置不能确定，等待后面优化吧！！

完成上面所说配置后，就再也不用担心启动小工具出现报错啦！！！