《DeepLung: Deep 3D Dual Path Nets for Automated Pulmonary Nodule Detection and Classification》网络模型解读

一、项目背景介绍

3D肺结节的检测和分类在医学领域是一个热门的研究方向,本文就这个问题选取一篇经典的论文进行解读。
下面附上论文下载链接及项目github网址;
Deep 3D Dual Path Nets for Automated Pulmonary Nodule Detection and Classification
github网址

二、网络模型解读之DeepLung框架

总的来说,作者设计了一个三维快速R-CNN用于结节检测,并提出了具有深三维DPN特征、原始结节CT像素和结节大小的GBM用于结节分类。
在这里插入图片描述
上面的网络很清楚,对于CT图像,首先使用检测子网(3D快速R-CNN)来检测候选者结节,接下来,使用分类子网(GBM)将检测到的结节分类为恶性或良性。接下来介绍这两个子网。

1. 3D快速R-CNN,用于结节检测的深3D双路径网络

任务说明:从原始图像中检测出肺结节的位置
网络结构:
包含3D双路径块和类似U-net的编码器 - 解码器结构
从图中可以看出,这是一个类似unet的网络结构,而双路径块是指图中的DPN块,接下来我们会讲这个双路径块是怎么回事。
双路径块说明:
双路径连接
双路径连接说明:x是输入,这里x流向2个方向,一个是用于正常的卷积操作,另一个是用于之后的部分的残差连接和另一部分的密集连接。经过两个卷积层之后,x变为F(x),这里d是超参数 用于决定要利用的新特征的数量。如F(x)[:d]表示取F(x)的前d个特征图,所以在relu前,级联后的输出应该是
在这里插入图片描述
G是ReLU激活函数,F是卷积层函数,x是双路径连接块的输入。relu前包含3个部分,一个是原始输入x的密集连接部分x[:d],一个是卷积后的密集连接部分F(x)[:d],另外一个是原始输入x的残差连接部分x[d:]与卷积后的残差部分F(x)[d:]之和。
双路径连接的优点:

  • 残差学习用于特征重用
  • 密集连接用于增加新的特征

2. 用于结节分类的三维双路径GBM

网络结构:
结节分类子网中的深3D双路径网络框架
包含30个3D双路径连接块。训练结束后,提取三维双路网络特征用于梯度增强机进行结节诊断。最后得到一个2560维的111图像。再用3D平均池化和二元逻辑回归层用于良性或恶性诊断。

三. 总结

在这项工作中,我们提出了一个全自动肺部计算机断层扫描(CT)癌症诊断系统DeepLung,DeepLung由两部分组成,结节检测(确定候选结节的位置)和分类(将候选结节分为良性或恶性)。具体为DeepLung系统包括使用3D Faster R-CNN的结节检测和使用具有构造特征的GBM结节分类。

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