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医学影像
菜鸟川
不要害怕未知,用已知推未知
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ADNI数据集相关概念初步整理
最近准备开始研究ADNI(Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative)数据集,刚在网站上注册和提交了申请(审核通过了才能下载数据集),审核时间大概是一周。在此期间,将数据集涉及的相关概念以及Alzheimer's Disease相关知识点做一些粗略整理。 在患者生前作出AD诊断,目前认为患者不但要具有进行性痴呆的临床表现,并且还要有AD的神...原创 2018-04-20 20:51:22 · 15306 阅读 · 13 评论 -
转:常见的医学影像数据格式(1)
常见的医学影像数据格式 在fMRI的早期,由于大多数据都用不同研究脉冲序列采集,然后离线大量重建,而且各研究中心文件格式各不相同、大多数的分析软件也都是各研究单位内部编写运用。如果这些数据不同其他中心交流,数据的格式不影响他们的使用。因此图像格式就像巴别塔似的多式多样。随着fMRI领域的不断发展,几种标准的文件格式逐渐得到了应用,数据分析软件包的使用促进了这些文件格式在不同研究中心和实验室的广泛运...转载 2018-05-14 17:20:30 · 5222 阅读 · 0 评论 -
转:常见的医学影像数据格式(2)
常见的医学影像数据格式(2)1. 医学影像学医学影像学Medical Imaging,是研究借助于某种介质(如X射线、电磁场、超声波等)与人体相互作用,把人体内部组织器官结构、密度以影像方式表现出来,供诊断医师根据影像提供的信息进行判断,从而对人体健康状况进行评价的一门科学,包括医学成像系统和医学图像处理两方面相对独立的研究方向。仪器主要包括X光成像仪器、CT(普通CT、螺旋CT)、正子扫描(PE...转载 2018-05-14 17:32:53 · 3287 阅读 · 0 评论 -
医学影像处理相关软件及python包
一、软件1. Freesurfer FreeSurfer是一个软件包,用于分析和可视化来自横断面或纵向研究的结构和功能神经影像数据。FreeSurfer为结构MRI数据提供完整的处理流,包括:颅骨剥离,B1偏置场校正和灰白质分割;重建皮质表面模型(灰白色边界表面和软脑膜表面);标记皮质表面上的区域以及皮层下的大脑结构;用立体定位图非线性配准个体的皮质表面;统计分析组形态测量差异。wi...原创 2018-06-07 21:36:17 · 11537 阅读 · 0 评论 -
matlab:将概率图与原始图像叠加生成热图
原始图像和概率图像叠加生成热图:function [map] = cmap()% 原始图像,需要进行灰度化,我这里直接读灰度图im = imread('1-1.png');im = double(im);% 概率图扩展范围是0-255gray = imread('1-2.png');gray = uint8(double(gray) * 255);% jet定义颜色,红-...原创 2018-12-12 22:21:16 · 4127 阅读 · 3 评论