python调用脚本_Python中调用其他脚本

作为一个搞生信的boy，我们在平时运行程序的时候避免不了在脚本中调用其他脚本的运行结果，但是作为一个用perl入门的菜鸟，习惯了perl直接用 `` 简单粗暴，到换python的时候就懵逼了，怎么才能调用其它脚本呢？下面我们就来絮叨絮叨：

1、通过os模块

1.1、最简单的办法，用 os.system(commond)：

os.system(commond)方法会创建子进程运行外部程序，但方法只返回外部程序的运行状态，所以导致我们不能将命令输出的内容存到变量中。

1.2、os.popen(commond, mode)：

os.popen(commond, mode)，该方法是打开一个与command进程之间的管道。将command的执行结果作为一个文件对象返回，可以读或者写(由mode决定，mode默认是'r')。如果mode为'r'，可以使用此函数的返回值调用read()来获取返回对象的内容。

2、通过commands模块

command.getoutput(command)，该方法将command的执行结果当作字符串返回。

command.getstatusoutput(command),该方法返回一个元组(status,output)，分别表示command执行的返回状态和执行结果。对command 的执行实际上是按照{command;} 2>&1的方式，所以output中包含控制台输出信息或者错误信息。

3、通过subprocess模块

subprocess.Popen(command)，是创建一个新的进程并与之通信，Popen是subprocess模块的一个类，用Popen类创建一个popen对象后，popen有以下方法：

popen.wait(): 等待子进程结束，并返回运行状态属性

popen.communicate()：与子进程进行交互。向stdin发送数据，或从stdout和stderr中读取数据。可选参数input指定发送到子进程的参数。Communicate()返回一个元组：(stdoutdata, stderrdata)。注意：我们在这希望将command的执行结果复制到python变量中，所以我们在创建Popen对象的时候，必须参数stdout=subprocess.PIPE。当然当我们想传参的时候，stdin也要同样设置。