直系同源基因ks_中国农大提出同源基因推断新策略，并构建小麦族同源基因数据库...

Mol Plant | 中国农大研究团队提出同源基因推断新策略，并构建小麦族同源基因数据库

来源 | Mol Plant

2020年9月23日，中国农业大学农学院小麦研究中心郭伟龙副教授作为通讯作者在Molecular Plant在线发表了题为“A Collinearity-incorporating Homology Inference Strategy for Connecting Emerging Assemblies in Triticeae Tribe as a Pilot Practice in the Plant Pangenomic Era”的研究论文。该研究团队通过融合序列相似性和基因共线性信息开发了适用于植物泛基因组时代同源基因推断的新策略(GeneTribe)，并构建了以小麦族物种为核心的“小麦族同源基”(Triticeae-GeneTribe, http://wheat.cau.edu.cn/TGT/)。基于小麦族物种基因组间和亚基因组间的共线性分析，该研究提出了六倍体普通小麦的“4A-5A-7B染色体重排”是两次染色体易位事件的结果，并明确了重排的基因组区间的精细边界；同时研究了春化基因Vrn2的复杂进化历史，提出Vrn2同源基因在普通小麦基因组中的复杂分布是包含串联重复、多倍化、染色体易位和基因丢失在内的一系列事件叠加的结果。该工作为泛基因组时代的植物比较基因组学研究和功能基因挖掘提供了新思路。