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Meta分析的结果使用森林图进行可视化展示很常见,其实COX生存分析也能用森林图展示。
之前分享过绘制KM曲线R|生存分析(1),诺莫图展示COX结果Nomogram(诺莫图) | Logistic、Cox生存分析结果可视化,本文将简单的介绍如何使用R-survminer包绘制Cox生存分析结果的森林图。
一 数据准备
本文同样使用上次的TCGA-LIHC队列的临床数据
#载入R函数包
library(survival)
library(survminer)
## 读取LIHC数据
LIHC
head(LIHC)
二 构建COX回归模型
对LIHC队列进行Cox回归分析,时间变量是time,结局变量是status,自变量选择 age,gender和 grade,结果如下:
#构建模型
model
model
好吧,虽然不显著,但是不影响后续森林图的绘制。
三 绘制森林图
1)ggforest绘制基础森林图
#基础森林图
ggforest(model, data = LIHC)
只需cox回归模型以及