图像分割评价_MICCAI 2020 医学影像分割比赛前瞻

2020/03/28 MICCAI 2020比赛接收列表公开了

https://www.miccai2020.org/en/MICCAI-2020-CHALLENGES.html​www.miccai2020.org

今年的比赛比往年更加规范化了，归功于以Lena Maier-Hein为chair的比赛工作小组，建立一套标准化的比赛申办准则，从而使得比赛更加的制度化和规范化。

向MICCAI比赛工作小组的成员致敬

今年一共有26个比赛，超过一半的比赛都跟分割相关，下图是跟分割相关比赛的列表

MICCAI 2020 分割比赛

比赛非常多样，设计到很多模态、器官、疾病和任务，绝大部分比赛都是从5月份释放数据，跟往年相比，今年比赛有如下特点：

• 更多的比赛要求参赛者提交docker来复现自己的算法；
• 很多比赛都采用了多中心的数据来检验模型的泛化能力；
• 排名时要做统计显著性检验，而不是仅看平均Dice

-----------以上是客观的比赛介绍，下面是主观的个人观点，请批判看待-------------------

公开比赛是很好的发现优质算法的平台，下面分享几个自己比较感兴趣的比赛

筛选准则

• 任务/数据新颖
• 测试集病例数量不要太少（测试集较少的比赛结果可能会有点随机）

3D Head and Neck Tumor Segmentation in PET/CT

AIcrowd | Challenges​www.aicrowd.com

任务：从头颈部PET/CT图像中自动分割肿瘤和淋巴结转移灶

主办方：Institute of Information Systems, University of Applied Sciences Western Switzerland (HESSO), Sierre, Switzerland

感兴趣原因：PET这种模态的图像自己还没接触过，过往的经历都是处理CT和MR居多。

Timeline

训练/测试数据

其他

• 评价指标：Dice
• 允许使用其它公开数据
• 奖励：第一名500欧元
• AIcrowd上提交分割结果不超过5次，最后一次为最终结果

Automated Segmentation Of Coronary Arteries

ASOCA - Grand Challenge​asoca.grand-challenge.org

任务：从CT中分割冠状动脉

主办方：School of Mechanical and Manufacturing, University of New South Wales

感兴趣原因：3D血管分割依旧是目前深度学习方法解决的不太好的任务

训练/测试数据：

其他

• 评价指标：Dice
• 允许使用其它公开数据
• 奖励：前10名合著一篇比赛介绍文章
• 提交分割结果不超过3次，最后一次为最终结果

Multi-Centre, Multi-Vendor & Multi-Disease Cardiac Image Segmentation Challenge

任务：从多中心的MR图像中分割左右心室和心肌

主办方：Universitat de Barcelona, Spain

感兴趣原因：用多中心的图像测试算法，更符合实际的临床环境，专门把这个问题拿出来作为比赛，也符合当前提升模型在unseen image上的分割研究热点；自己和小伙伴们也创建了个1000+病例多中心的数据，从这个比赛能学习benchmark的设置。

训练/测试数据：

其他

• 评价指标：Dice，Jaccard, surface distance和 HD https://github.com/loli/medpy/
• 不允许使用其它数据
• 奖励：Top 3奖励500/300/200欧元；合著journal文章
• 提交算法Docker

Quantification of Uncertainties in Biomedical Image Quantification

任务：肿瘤分割的不确定性估计

主办方：TUM

感兴趣原因：不确定性是自己近期在探索的课题，前期的积累跟这个比赛很match

官网和具体时间TBA

训练/测试数据：

其他

• 评价指标：Dice
• 允许使用其它公开数据
• 奖励：奖状+跟组织者合影
• 提交算法Docker

关于过往比赛经验

• 有些比赛去年已经在MICCAI 2019办过了，今年增加了训练数据继续办，下面是去年比赛Top方案的一些简单介绍，希望对您能有帮助

JunMa：MICCAI 2019 VerSeg 2019冠军方案学习笔记​zhuanlan.zhihu.com

JunMa：MICCAI 2019 StructSeg冠军方案学习笔记​zhuanlan.zhihu.com

JunMa：MICCAI 2019脑肿瘤分割挑战赛冠军方法学习笔记​zhuanlan.zhihu.com