matlab 生物信息学工具箱,matlab学习--bioinformatics toolbox学习之一

matlab工具箱中的生物信息学工具箱(bioinformatics toolbox)功能还算全面，虽然没有什么突出的优点

。包含了：蛋白和核酸分析，系统发育分析以及基因芯片分析等功能。

1、序列分析：以下，带有>>的为命令行！！

例如，我们要查询

RefSeq的一条序列NM_000799，

>> a =

getgenbank('NM_000799','ToFile','testbank');

%利用getgenbank函数，可以设置所需信息的各种参数。

%getgenbank('accession',TOFILE',FILENAME)：可以将信息写入文件；

%getgenbank('accession','SEQUENCEONLY',true);可以只提取序列信息；

%getgenbank('accession'，'PARTIALSEQ',SEQPARAMS)；可以只提取一部分序列，SEQPARAMS为[N,M];

%getgenbank('accession'，'fileformat',fmt)；fmt可以为genbank或者fasta。

>>ntseq =

a.Sequence %这个是结构数组，就是在数组变量名后面加一个圆点,例如array.substructure

>>ntdensity(ntseq)

%图示核酸序列各种核苷酸含量&#