小鼠脑立体定位图谱_超高分辨率小鼠脑三维图谱发布——脑研究者的屠龙刀

最新推荐文章于 2021-08-17 14:03:31 发布

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文章标签：小鼠脑立体定位图谱

ALLEN脑科学研究所发布第三代小鼠脑框架(CCFv3)，解决了2D到3D转换的失真问题，提供10μm分辨率的全脑空间图谱模板，详细注释了皮质和皮质下结构，为脑科学研究提供精准工具。

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大脑，作为生命活动的司令部，是结构和功能最为复杂的一种器官。因此，识别脑的三维结构，对于脑科学研究至关重要。然而由于技术的限制和脑结构的复杂性，多数脑形态结构图谱绘制工作局限于二维层面，高精度的小鼠脑三维参考图谱仍然进展缓慢。来自于ALLEN脑科学研究所的Lydia Ng团队历时三年，最终完成了迄今为止精度最高的小鼠脑三维图谱的构建——第三代小鼠脑框架(Mouse Brain Common Coordinate Framework,CCFv3)，相关工作于2020年4月发表在《cell》杂志。

脑图谱的绘制工作主要包括两个部分：(1)脑图像的采集；(2)对采集的脑图像进行区域划分和结构注释。目前标准的2D小鼠脑图谱是在采集小鼠脑切片图像的基础上来划分区域和注释结构的，例如艾伦参考图谱(ARA)和小鼠脑立体定位坐标(MBSC)。脑区的划分及注释可以基于细胞结构染色和髓鞘结构染色结果，同时也可以利用不同的基因表达、脑区间的连接模式与功能性质。不同模态的数据集都有可能揭示某些大脑区域的独特特征，多模态的结合将有望提高脑区域绘制的精度。然而，系统整合多模态的哺乳动物脑图谱尚未出现。

在此之前，来自美国西雅图的Allen脑科学研究所已经发布过了小鼠脑的3D参考图谱第一版和第二版(The Allen Mouse Brain Common Coordinate Framework ,CCF)，但是仍然存在