做细胞研究,怎么能不会线粒体?
线粒体(Mitochondrion)是一种存在于大多数细胞中的由两层膜包被的细胞器,是细胞中制造能量的结构,是细胞进行有氧呼吸的主要场所。
活细胞中线粒体存在融合和裂变的动态循环稳态,研究表明,融合和裂变的平衡直接影响线粒体网络形态并由此影响ATP稳态和细胞功能,在细胞的生理和病理过程中扮演了十分重要的角色。
目前最常见的线粒体形态检测方法包括电镜法和共聚焦显微镜法,电镜只能获取静态图像,而共聚焦显微镜由于其优秀的动态检测能力,在线粒体网络研究中得到了更广泛的应用。
那么如何对线粒体进行形态学分析?目前大部分线粒体分析软件均为商用软件,已有的免费软件很难分析比较厚的细胞或存在密集线粒体网络的细胞(如胰岛β细胞)。
今天半夏给大家分享基于美国NIH开发的ImageJ软件进行线粒体形态学分析。ImageJ(https://imagej.nih.gov/ij/)是美国NIH开发的免费开源图像处理软件,广泛的应用于生物、医学领域。
Fiji是已经预装了诸多生物医学分析的常用插件的ImageJ,其下载链接为:https://imagej.net/Fiji/Downloads。
![c851b576f43d7de1e37207237863ee1d.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/90851df8d5f0015f27a20a5725a3d991.jpeg)
Mitochondria Analyzer分析线粒体网络
Mitochondria Analyzer插件将3D ImageJ Suite、ImageScience、IJPB-Plugins(MorphoLibJ)等插件联用,可以实现复杂线粒体网络的2D、2D时间序列(xyt),3D和4D(xyzt)图像分析;同时还支持多通道的同时分析【1】。
1. Mitochondria Analyzer插件安装方法
Mitochondria Analyzer要求ImageJ 1.52版本或以上,且只能在Windows中运行,目前没有Mac OS版本。
可以通过以下方式安装Mitochondria Analyzer及所有分析所需插件:
ImageJ主界面 -> help -> Update,打开ImageJ Updater主界面,点击Manage Update Sites:
![716ada74a2957f0596d26c780f92da86.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/c515d64808b78032af017005836c4c0e.jpeg)
勾选以下站点:a. 3D ImageJ Suite;b. ImageScience ;c. IJPB-Plugins。
![81ec961ef2943359cb9222eea0b87233.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/516865e5d74a3ec8b89c27ab273e1732.jpeg)
点击Add Update Site,在Name中输入Mitochondria Analyzer,在URL中输入http://sites.imagej.net/ACMito/,依次点击Close -> Apply Changes:
![f1b89452ca7aa016b6ae014c4bcf4ae6.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/8054325b6cd414d0f4961ea007b27fa5.jpeg)
重启ImageJ/FiJi,检查下载的文件是否在Update文件夹中,如果在,将其转移到Plugins文件夹中&