进行研究时,选择图像模式一般很容易,说实话:向团队或客户传达图像模式有时要困难得多。 不仅很难用外行术语解释某些图像模式(尝试向非数学家解释一个数学符号),而且有时,您还需要试图表示对各种模式需要依赖的条件……怎么说呢?
图表对于我们研究人员至关重要,因此我们需要它们能够很好地传达我们的意思。 如果没有这些,我们的知识和发现所承担的责任要轻得多,但图表仍然具有最佳的视觉效果,所以我们需要确保图表可以尽可能地传达我们的发现。
在下面,我将讨论Seaborn以及为什么我相对于其他第三方库更喜欢它。 我还将给出我经常使用的3张图表。
为什么选择Seaborn
令人惊讶的是,流行的Python图表库很少而且功能相差甚远,因为很难进行一刀切的设置:认为Matplotlib旨在反映Matlab输出和ggplot,与R语言中的绘图方式相似。
关于为什么我更喜欢Seaborn而不是其他第三方库的原因:Seaborn与Matplotlib比需要少得多的代码就可以生成类似的高质量输出
Chartifys的视觉效果不是很好(Spotify-有点太笨拙了)。
ggplot似乎不是Python固有的,所以感觉我一直在努力使它对我有用。
Plotly有一个“社区版本”,这让我对这部分未来是否许可有一定担忧,因此我通常会远离这些内容。 从设计角度和功能上来说,它实际上是相当不错的,并且提供了广泛的产品组合,但是,它并没有比Seaborn好多少。
最重要的是,研究人员通常需要花费大量时间来绘制分布图,如果不能轻松地绘制分布图,则您的绘制程序包实际上是多余的。 Seaborn绘制直方图很方便,而KDE与其他软件包确实很难做到(Plotly例外)。
最后,Seaborn涵盖了所有设计方面的内容,这使您(研究人员)有更多的时间进行研究。 Matplotlib的视觉效果很不好,Chartify太难以使用,我都不太喜欢。
单变量分布图
如果您发现了一个随机变量,其分布有一定规律,那么Seaborn的调度功能将非常有用。 通过显示以下内容有助于传达图片特征:直方图形式的基础分布
顶部附近有一个近似功能,可以提供平滑的图像
网格线和清晰的字体颜色(漂亮的半透明的蓝色)可提供简单有效的服务!
联合分布
在这里,我们尝试传达更多更复杂的动态信息。 我们有两个我们认为应该关联的变量,但是如何可视化这种关系呢?
图表两个侧面分布非常适合从视觉上观察边缘分布,而面积图非常适合识别密度较大的区域。
我在研究和文章中都使用了这种图,因为它使我能够将单变量动力学(带有内核图)和联合动力学保持在我的思想和观察的最前沿:所有这些都在传达我所经历的思考。 在分层讨论方面非常有用,我强烈建议您使用。
箱形图和晶须图
分布图的问题在于,它们常常会被异常值扭曲,除非您知道这些异常值存在并且进行处理。
箱形图得到了广泛的使用,它是一种显示可靠的指标的有效方法,例如中位数和四分位数范围,它们对于异常值(由于其较高的分解点)具有更大的弹性,
Seaborn的箱形图实施方式看起来很棒,因为它可以突出显示多个维度来传达一个相当复杂的指标,同时,其视觉效果也足以适合学术期刊。 此外,Seaborn还出色地完成了提高代码效率的工作,从而使研究人员不必花时间来使代码可读。
同时识别和讨论多种功能和模式对于您的研究成功至关重要,因此,我强烈建议您使用此图表。 同时,您需要确保将图表定位到您的受众群体!
在上面的文章中,我广泛讨论了为什么对我来说Seaborn是最好的绘图程序包,并给出了我使用的3个图表示例。 我坚信以一种容易理解的方式传达信息:文字越少越好! 坚持才是关键!
这些图表使您轻松地做到这一点,因此,如果您是视觉研究员,或者如果您喜欢看全局,那么Seaborn就适合您。
再次感谢,如果您有任何疑问,请告诉我!
代码
以下代码段是用于创建上面很棒的图表的简单代码段!
图0:子图
import seaborn as sns
df = sns.load_dataset(“iris”)
sns.pairplot(df, hue=”species”)
图1:单变量分布
x = np.random.normal(size=100)
sns.distplot(x);
图2:联合分布
mean, cov = [0, 1], [(1, .5), (.5, 1)]
data = np.random.multivariate_normal(mean, cov, 200)
df = pd.DataFrame(data, columns=["x", "y"])
sns.jointplot(x="x", y="y", data=df, kind="kde");
图3:多变量联合分布
iris = sns.load_dataset('iris')
g = sns.PairGrid(iris)
g.map_diag(sns.kdeplot)
g.map_offdiag(sns.kdeplot, n_levels=6);
图4:箱形图和晶须图
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as pltsns.set(style="ticks")# Initialize the figure with a logarithmic x axis
f, ax = plt.subplots(figsize=(7, 6))
ax.set_xscale("log")# Load the example planets dataset
planets = sns.load_dataset("planets")# Plot the orbital period with horizontal boxes
sns.boxplot(x="distance", y="method", data=planets,whis="range", palette="vlag")# Add in points to show each observation
sns.swarmplot(x="distance", y="method", data=planets,size=2, color=".3", linewidth=0)# Tweak the visual presentation
ax.xaxis.grid(True)
ax.set(ylabel="")
sns.despine(trim=True, left=True)
作者:Sohaib Ahmad
翻译:孟翔杰