将eigen头文件一起编译_alamode 编译安装教程

最新推荐文章于 2024-01-15 13:13:22 发布
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文章标签： 将eigen头文件一起编译
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本文是alamode的编译安装教程，详细介绍了如何在TH-HPC集群上配置编译环境，包括MPI编译器、cmake、MKL库等。教程特别强调了对boost、eigen和spglib的处理，其中eigen只需配置头文件的软连接。此外，还提供了编译alm、anphon和tools的具体步骤，以及如何修改Makefile文件以适应不同的编译器和库路径。最后，给出了一个简易脚本make-alamode.sh，帮助用户快速完成alamode的编译。
摘要由CSDN通过智能技术生成

# alamode编译安装教程

# 简介

ALAMODE是一个开源软件，用于分析固体的晶格非谐性和晶格导热系数。通过使用外部DFT软件包，如VASP和Quantum ESPRESSO，您可以使用ALAMODE直接提取谐波和非简谐力常数。利用计算出的非简谐力常数，你还可以根据第一原理估算晶格热导率、声子线宽和其他非谐声子性质。

# 安装

# 配置编译环境

编译环境需要： 编译器

MPI编译器

cmake命令

MKL库

我们在TH-HPC集群使用如下编译环境：

提示

不同系统加载编译环境方式不同，请根据系统用户手册加载相关编译环境。也可以用GNU Compiler等编译器。

# 安装依赖库

# boost

不需要编译库，只需要配置头文件的软连接。

# eigen

不需要编译库，只需要配置头文件的软连接

# spglib

这个库需要编译安装，并配置环境变量。后续需要用到相关头文件和库进行编译链接。

注意

设置了安装目录为：$HOME/software/spglib-1.16.0，用户可以自行选择安装目录，随意即可，注意设置相同安装目录为SPGLIB_ROOT即可。

# 安装ALAMODE

官网说明提示，安装alamode软件需要安装三个部分： alm

anphon

tools

下面依次安装相关部分。

# 解压缩

# alm

稍微修改一下Makefile文件，编译即可生成alm

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weixin_39786534
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-lstdc++
Micheal
01-18 9655
编译C++程序的时候一定是用到了C++的库，所以用gcc编译时候，既有cpp文件又有c文件时候需要加上-lstdc++。 -l 后面加的是动态库libstdc++.-l加的时候，把"lib"三个字符省略，例如链接libtest.so你就需要加 -ltest ,一般这个库在usr/lib下可以找到
lstdc++ 库
09-28
在升级到Xcode10，会发现library not found for -lstdc++.6.0.9的报错，
-lstdc++这里使用C++库
一步一步往上爬
07-15 732
l 后面加的是动态库libstdc++.-l加的时候，把"lib"三个字符省略，例如链接libtest.so你就需要加 -ltest ,一般这个库在usr/lib下可以找到。编译C++程序的时候一定是用到了C++的库，所以用gcc编译时候，既有cpp文件又有c文件时候需要加上-lstdc++。
eigen库安装_VASP环境安装-Alamode软件安装
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lstdc++.6 libstdc++.6.0.9.tbd
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xocde10 解决library not found for -lstdc++.6 和library not found for -lstdc++.6.0.9 问题
DFT的matlab源代码-alamode:从头算模拟器进行热传输和晶格非谐性
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DFT的matlab源代码ALAMODE 版本1.2.0 介绍 ALAMODE是一款科学软件，旨在分析固体的晶格非谐性和晶格热导率。 通过使用外部DFT软件包（例如VASP和Quantum ESPRESSO），您可以使用ALAMODE直接提取谐波和非谐波力常数。 使用计算出的非谐声常数，您还可以根据第一原理估算晶格热导率，声子线宽和其他非谐声子性质。 特征 一般的 基于超级单元方法的谐波和非谐力常数的提取 适用于任何晶体结构和低维系统 与VASP，Quantum-ESPRESSO，OpenMX，xTAPP和LAMMPS代码的接口 使用MPI + OpenMP并行化 谐波特性 声子分散 声子DOS，原子投射声子DOS 二声子DOS 振动热力学函数（热容量，熵，自由能） 均方位移 声子模式的动画和可视化（需要VMD或XCrysDen） 3声子散射相空间 声子同位素散射率 参与比分析声子模式的局域性 非谐波特性 通过立方力常数的Gruneisen参数 BTE-RTA的晶格热导率 累积热导率 晶格导热系数的相干成分 3声子相互作用产生的声子线宽 由于3和4声子相互作用而引起的声子频移 温度相关
ALAMODE:从头算模拟器进行热传输和晶格非谐性-开源
04-29
ALAMODE设计用于分析固体的晶格非谐性和晶格热导率。 通过使用外部DFT软件包（例如VASP和Quantum ESPRESSO），您可以使用ALAMODE直接提取谐波和非谐波力常数。 使用非谐力常数，您还可以根据第一原理计算晶格热导率。 有关ALAMODE的更多信息，请访问以下网页：文档：http://alamode.readthedocs.io/en/latest/ git存储库：https://github.com/ttadano/alamode
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