在线花店系统需求分析_在线富集分析工具，5秒打包您所有的富集分析需求

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老师们筛选到自己感兴趣的基因之后是否会有如下需求和疑问：

1、这些基因主要的生物功能是什么？

2、这些基因主要涉及什么信号通路？

3、怎么绘制精美的富集统计图？

4、怎么查看这些基因在通路图中的信息？

本文通过介绍欧易在线富集分析工具

(https://cloud.oebiotech.cn/task/array_enrichment/)为大家一次性解决如上问题，准备好您的基因列表，轻点鼠标“选择文件”—“提交”，便可轻松获得富集分析打包结果(包含：富集统计结果、富集条形图、气泡图、网页报告......)啦！

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GO和KEGG基本概念

在介绍小工具之前，先跟大家简单分享一下GO和KEGG的基本概念。

Gene Ontology(GO)数据库^[1][2]提供了专业的术语来定义基因产物的属性。它包含三大类：生物学过程(Biological Process，BP)；细胞组分(Cellular Component，CC)；分子功能(Molecular Function，MF)。GO富集分析对目标基因进行GO分析，从而对这个基因的功能进行描述。

Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)是系统分析基因功能、联系基因组信息和功能信息的数据库。KEGG富集分析利用KEGG数据对目标基因进行Pathway分析，可以获取目标基因显著相关的Pathway，从而推断目标基因集合可能和哪些Pathway的改变有关。

 

接下来我们正式进入干货时间……

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在线富集分析操作步骤

通过传送门进入分析界面

https://cloud.oebiotech.cn/task/array_enrichment/

Step1: 上传基因表格

上传的表格文件格式可以是txt、xls、xlsx和csv中的任何一种，其添加数据类型有如下两个形式

- 两种表格形式 -

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Step2:物种选择

(1)人，大鼠，小鼠物种选择

只需选择对应物种名称

(2)其它物种选择

需上传对应物种富集背景文件(老师们如果是在欧易做的项目，都会免费提供该文件哟，欢迎联系索取！)

Step3: 提交任务

添加“提交”后即可等待结果的输出，结果为zip压缩文件，解压即可得到全部富集分析内容

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富集分析结果查看

输出文件结构图：

1、GO 结果

打开“GO_Enrichment”文件夹，可以看到一份html的网页报告，报告内容分如下三部分。

第一部分：GO分析概述

第二部分：GO图形结果展示

第三部分：GO结果表格数据

2、KEGG结果

打开“KEGG_Enrichment”文件夹，可以获取一份html网页报告，报告内容分如下三部分。

第一部分：KEGG分析概述

第二部分：KEGG图形结果展示

第三部分：KEGG结果表格数据

以上就是我们欧易在线富集分析小工具的操作步骤和结果查看说明，欢迎各位老师前往尝试(https://cloud.oebiotech.cn/task/array_enrichment/)，体验自己动手分析数据的快乐~~

参考文献

1.Ashburner et al. Gene ontology: tool for the unification of biology. Nat Genet. May 2000;25(1):25-9.  2.The Gene Ontology Consortium. The Gene Ontology Resource: 20 years and still GOing strong. Nucleic Acids Res. Jan 2019;47(D1):D330-D338. 

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 欧易小强  撰文 本文系欧易生物原创 欢迎转发到朋友圈 转载请注明本文转自欧易生物

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