invalid signature什么意思_讨论记录用随机森林对生存数据降维，筛选signature

最新推荐文章于 2024-04-29 02:08:49 发布
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本文记录了一次关于使用随机森林进行生存数据分析的讨论。大鱼海棠分享了如何利用随机森林对生存数据降维，筛选出基因signature，并建议在多因素COX回归中不进行变量筛选。讨论中涉及了基因筛选、预后signature构建、数据归一化、不同平台数据处理以及模型验证等问题。
摘要由CSDN通过智能技术生成

昨晚，小伙伴收到了大鱼海棠为我们带来的FigureYa182RFSurv，使用随机森林对生存数据降维，根据变量重要性排序并筛选基因组成prognostic signature。

这是我们第二次众筹随机森林相关分析，上次的FigureYa159LR_RF，是在LASSO降维的基础上，采用logistic regression或Random forest的方法，进行5-fold cross-validation评估LASSO selected feature的预测效能。

大鱼海棠为我们带来了众多或经典或酷炫的好用代码，具有丰富的医学统计分析经验。这次建立FigureYa182RFSurv专属讨论群，请大鱼海棠入群答疑。小伙伴就相关问题展开讨论，小丫整理记录下来，留下这宝贵资源。

HSZ：请问这个安装是哪里出问题了，我百度也不知道怎么解决？

2b7d68a781bdff9634bc97c164251d3c.png

大鱼海棠：https://share.weiyun.com/0Qk7bvR6，直接把这个拖到R的library下解压试试，我以前这样做似乎也可以用，在windows里。

ZJH问：老师，您好！imp.cutoff这个重要性阈值的怎么选择？

大鱼海棠：没

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weixin_39814454
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