lapack安装_全外显子CNV分析软件XHMM安装教程

    最近在做不同的WES CNV分析软件性能评估。开始搭流程了，装软件又是个很麻烦的环节。这次分享的是14年发表的基于全外显子测序数据的拷贝数分析软件XHMM[1]。安装的过程遇到不少坑，这里就写个文档吧，方便后来者避坑。

首先是找到软件的下载链接和安装文档：

下载链接及安装文档：https://atgu.mgh.harvard.edu/xhmm/download.shtml

要求gcc 编译器版本>4.4，且需要安装依赖的c语言库。gcc和pthread的安装比较简单，查找相应的安装命令后直接安装即可，lapack的安装过程比较繁琐，这里写个文档，当做笔记，也可以给同行分享。

lapack库的安装过程参考下面的CSDN链接：

https://blog.csdn.net/baiyang3/article/details/52790793

要安装lapack还得安装其依赖的BLAS 库，这两个数学库是很多linux 科学计算软件需要调用的，所以经常会用到。

LAPACK，其名为Linear Algebra PACKage 的缩写，是一以Fortran 编程语言写就，用于数值计算的函式集。LAPACK提供了丰富的工具函式，可用于诸如解多元线性方程式、线性系统方程组的最小平方解、