学习vbm分析,使用了dparsfa的新分割与dartel的模板处理,非常方便,但是我想知道软件内部具体的操作流程与参数如何设置的?最后出来的结果应该是平滑过了,平滑核是多少?直接统计好像都是散点,我自己又平滑(8)一次;我自己又按vbm tutorial(john ashburner写的)的流程与参数跑了一遍,感觉出来结果不同,所以想知道贵软件vbm的流程参数设置如何,与vbm tutorial文中区别在哪里?还有贵软件做vbm过程中,dicom格式转换有问题,co前缀有时候缺失,软件就卡住了;我自己mricron转好,放入T1img,勾掉dicom转换,发现软件又不能跑下去;后来发现从NII文件开始,也要建立T1raw的文件夹,里面还得有相关文件夹(空的也行);是否也可按功能数据一样,选从哪步开始。
跑完数据后,smwc1前缀的文件是121*145*121,1.5*1.5*1.5,接下去是我最困惑的地方,我一直是用rest的,我是应该讲这批数据重采样成restBrainMask_05_61x73x61的3*3*3做下去?但是用rest工具里reslice image发现无法重采样一组数据,bug?于是我只好将mask重采样成1.5*1.5*1.5了,spm双样本分析好,想用sliceviewer看,提示this NifTi image includes an rotation transformation.You should reslice this data before attempting to overlay the image,由于自身对vbm一知半解,卡在这里,请老师指教,万分感谢!