基于SPM8或CAT12进行的VBM分析

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基于SPM8或CAT12进行的VBM分析

需要的工具:Matlab及SPM8/SPM12

一、SPM8/12的VBM分析

1)首先将DICOM格式转换为NIFTI格式;
2)用display查看图像,可以手动进行AC-PC校正(此时最好校正,后面需要用到);
3)图像分割:运用new segment将T1结构像分割为灰质、白质、脑脊液。
4)DARTEL:具体的原理我也不是很清楚,此步比较耗时。
5)标准化:Normorlize FHWM=8

二、CAT12的VBM分析

1)首先将DICOM格式转换为NIFTI格式;
2)用display查看图像,可以手动进行AC-PC校正(此时最好校正,后面需要用到);
3)运用CAT12的segment按钮,选项用默认值;
4)平滑:smooth:FHWM=8

三、统计分析:

1)矩阵设计:根据你的实验设计选用factorial design
2)估计:estimate
3)结果展示:点击results
4)可用xjview可视化统计分析结果
5)MRIcron可帮助查看结果


基于CAT12和SPM12进行vBMSBM数据分析的主要步骤如下: 1. 数据预处理:使用CAT12对原始的结构磁共振数据进行预处理,包括分割、灰质和白质提取,使其符合后续分析的要求。 2. 群体学习方法:使用vBMSBM(variational Bayes mixture of sparse Bayesian models)来进行脑结构网络的分析vBMSBM是一种群体学习方法,能够根据个体特点进行网络分析,而不需要在个体之间进行直接比较。该方法可以识别出不同的网络模式,并将其归类为特定的类别。 3. 网络构建:使用SPM12对预处理后的数据进行网络构建。在构建网络过程中,可以选择不同的连接方式,如全连接、图模型拓扑等,以研究不同尺度的网络特征。 4. 可视化分析:使用MATLAB或其他相关软件工具,对网络结果进行可视化分析。可以绘制网络图,查看不同网络模式之间的连接强度,并用不同颜色表示不同网络模式。 5. 统计分析:对网络结果进行统计分析,例如计算网络的全局度和局部度、网络的小世界性质等,以探索不同网络模式之间的差异与关联。 6. 结果解读:根据统计分析得到的结果,结合相关文献和领域知识,对不同网络模式之间的差异进行解读,并提出相应的假设和解释。 综上所述,基于CAT12和SPM12进行vBMSBM数据分析,可以从多个层面对脑结构网络进行研究,为理解脑结构与功能之间的关系提供有力的支持。
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