vasp 安装_VASP5.4.1及+VTST编译安装

VASP采用平面波赝势（或缀加投影波）方法进行从头计算分子动力学模拟的软件包。官网：https://www.vasp.at

VTST是VASP的过渡态工具，下载地址：http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/index.html

VASP及VTST安装均无需root权限，普通用户在自己的目录下也可以安装使用。

VASP.5.4.1编译安装：

1.解压缩VASP源码包：tar xvf vasp.5.4.1.tar.bz2 ，解压缩后的目录为vasp.5.4.1。

2.进入vasp.5.4.1目录：cd vasp.5.4.1

3.查看vasp.5.4.1目录下有何内容：ls -l

查看说明：more README

注：

vasp.X.X.X：解压缩后的根目录

arch：针对不同架构的Makefile模板，如里面含有makefile.include.linux_intel

bin：编译后的可执行程序文件

build：编译时自动复制src目录内源码后执行编译的目录

src：源码目录

lib：库目录，对应以前的vasp.lib目录

CUDA：GPU CUDA代码目录

4.查看所用的编译器：which ifort

如显示不存在，那么可以类似下面设置下Intel编译器环境（具体路径与你所使用的系统有关）：

. /opt/intel/composer_xe_2015.1.133/bin/compilervars.sh intel64

5.查看Intel MKL环境：echo $MKLROOT

如显示不存在，那么可以类似下面设置下Intel MKL环境（最好与编译器版本一致）：
. /opt/intel/composer_xe_2015.1.133/mkl/bin/mklvars.sh intel64
6.查看Intel MPI环境（最好与编译器版本一致）：which mpiifort
如显示不存在，那么可以类似下面设置下Intel MPI环境：
. /opt/intel/impi/5.0.2.044/bin64/mpivars.sh intel64
查看是否存在/opt/intel/composer_xe_2015.1.133/mkl/interfaces/fftw3xf/libfftw3xf_intel.a，如没存在，那么可以在自己目录下编译生成libfftw3xf_intel.a：mkdir -p ~/local/interfaces
cp -a /opt/intel/composer_xe_2015.1.133/mkl/interfaces/fftw3xf ~/local/interfaces
cd ~/local/interfaces/fftw3xf
make libintel64
顺利的话，将在此目录下生成libfftw3xf_intel.a。
7.采用arch/makefile.include.linux_intel做为模板（在vasp.5.4.1目录下，未考虑CUDA）：
cp arch/makefile.include.linux_intel makefile.include
8.修改makefile.include：
必要时修改OBJECTS那，将
$(MKLROOT)/interfaces/fftw3xf/libfftw3xf_intel.a
修改为（假如使用~/local/interfaces/fftw3xf）：

其它参数，请见VASP官方说明。
9.为防止以前编译好的.o和.a文件与新修改的编译配置冲突，建议清除以前编译文件：
make veryclean
10.执行编译，可以默认编译或分开编译：
默认编译（将编译生成std、gam和ncl版）：make
分开编译：
编译标准std版：make std
编译gamma-only版：make gam
编译non-collinear版：make ncl
编译完成后将在bin目录下生成对应的版本的可执行程序：vasp_gam、vasp_ncl、vasp_std。
如果有错，请注意看错误信息，然后根据信息进行处理。VASP.5.4.1+VTST编译安装：
步骤基本和 VASP编译安装步骤一致。在上述第3步和第4步之间加入如下操作：
设置VTST：
wget http://theory.cm.utexas.edu/code/vtstcode.tgz
tar xvf vtstcode.tgz
下载：解压缩：之后会生成vtstcode-171目录，此目录内包含以下文件： bbm.F bdr_changes bfgs.F cg.F chain.F dimer.F dynamic.F dynmat.F fire.F instanton.F lanczos.F lbfgs.F mkbdrpro.pl neb.F opt.F qm.F sd.F vasp-5.3.2-main.patch vasp-5.3.2-mpmd.patch vasp-5.4.1-mpmd.patch
根据官方安装说明http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/installation.html：

需要将这些文件复制到src目录中：
因为src目录下存在chain.F，建议先备份chain.F（可选）：cp src/chain.F src/chain.F-org
将vtstcode-171目录下文件复制到src下：cp vtstcode-171/* src/
修改src/main.F源码：
将（第3233行）

• CALL CHAIN_FORCE(T_INFO%NIONS,DYN%POSION,TOTEN,TIFOR, & LATT_CUR%A,LATT_CUR%B,IO%IU6)
  变为（注意后两行）：
  CALL CHAIN_FORCE(T_INFO%NIONS,DYN%POSION,TOTEN,TIFOR, & TSIF,LATT_CUR%A,LATT_CUR%B,IO%IU6) ! LATT_CUR%A,LATT_CUR%B,IO%IU6)
• 修改编译配置src/.objects，在chain.o前（大概第67行）添加如下内容： bfgs.o dynmat.o instanton.o lbfgs.o sd.o cg.o dimer.o bbm.o fire.o lanczos.o neb.o qm.o opt.o

注意后不能有空格。

如果有错，请注意看错误信息，然后根据信息进行处理。