java队列研究_Evvail | 时间序列研究-STEM（Short Time-series Expression Miner） | Omics - Hunter...

时间序列相关的软件在生物学研究相对比较少见( 主要可能是我接触的比较少)，金融行业对时间序列的研究就非常多了，之前的一篇文章介绍了Mfuzz通过软聚类的方法来研究类似时间序列找出关键的cluster的方法也是非常不错的研究思路。

今天主要介绍STEM的简单使用，STEM由java语言编写而成(需要java环境，java 1.4+)的可视化操作的分析软件，主要是用于对短的时间序列的基因表达数据(少于或等于8个时间点)进行聚类、比较和可视化，整体来说操作非常简单，主要含有两个输入和一个选项、以及一个执行模块：

1)运行软件，输入时间序列的表达数据

g27_1.txt数据文件的格式( 注意 ：Spot列是序号列，如果你不想手动添加，不选择Spot IDs included in the data file选项)，如下：

我们也可以选择数据预处