结果解读_看图说话|STEM趋势分析结果解读

上周日我们给大家分享了一篇利用小工具STEM进行趋势分析的文章——工具篇|做了不同时间点的测序后，STEM帮你找特定表达模式的一类基因，后台有好多小伙伴表示很感兴趣，想要进一步了解下STEM分析的结果该如何解读。下面Linlin就那篇文章里的结果图给大家唠一唠STEM结果该怎么看。

趋势分析：在生物学研究领域，趋势分析就是寻找随时间、温度、药物浓度等变量的变化而发生一定规律变化的基因，这些与时间或环境变量密切相关的基因被认为能够揭示生物样本在这些变量变化过程中所特有的规律。(是不是有点绕，其实往简单了说趋势分析就是挑选出随时间、温度或药物浓度变化而显著变化的一群基因)

看图说话：

1. 将5组不同时间点的基因表达信息总表导入到STEM软件后，STEM就会进行强大的计算，将具有相同表达趋势的基因进行聚类，获得一个个cluster(基因模块)。如下图所示是5组不同时间点下所有基因趋势变化汇总图，每一个小正方形是一个cluster，包含了一群具有相同表达趋势的基因，小正方形左上角的数字是cluster编号，从图中可以看出这组数据供获得了从0-49共50个cluster。