python在生物中的应用_生物信息Python-从入门到精通?

Python开发的方向太多了,有机器学习,数据挖掘,网络开发,爬虫等等。其实在生信领域,Python还显现不出绝对的优势,生信的大部分软件流程都是用shell或Perl写的,而且已经足够好用了。我选Python是因为我想顺便学点数据挖掘和机器学习的东西,而且Python这些年越来越火,发展势头远超其他脚本语言,所以学它肯定是没错的。

一、入门标准

入门比较难定义,什么程度才算入门呢?

1. 掌握基本的语法,熟练使用python的内置类型、内置函数和数据结构。

2. 了解一些基本的模块的使用,能够实现一些简单的需求。

后面有一个实例,如果你能简单的做完,那我敢肯定你已经入门了。

二、基本知识点

1.基本语法

缩进:Python是通过代码缩进来决定代码层次逻辑的,一般约定使用4个空格

版本问题:主要包括2.x系列的和3.x系列的,两者语法不同且不兼容,有的模块只能在指定版本下安装。建议使用3.x Python,碰到特殊问题再去使用指定版本

文件编码声明:python会去环境变量里寻找python解释器。如果代码里有中文,则要以utf-8编码

#!/usr/bin/env python#-*- coding: utf-8 –*-

变量定义:使用前要先定义

dir():列出一个数据类型或对象的所有方法,非常好用,同help()

文件操作:f = open(),f.close();with open() as f: ,os.path.exists(),os.path.isfile()&#x

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