python卡方检验 scipy_Fisher 精确检验 与卡方检验

本文介绍了Fisher精确检验的概念和应用,通过一个实例解释了如何进行Fisher精确检验,并提供了Python实现。此外,还讲解了卡方检验的原理,包括未校正和校正的卡方计算,以及何时选择使用Fisher检验或卡方检验的准则。
摘要由CSDN通过智能技术生成

Fisher精确检验是基于超几何分布计算的,它分为两种,分别是单边检验(等同于超几何检验)和双边检验。

应用于将对象分成两组后的分类数据,以检查两组分类间是否有显著关系。

举个例子:

我想知道颜值高的人是不是数学成绩也好(数据瞎编的),于是我们随机抽出10个人,5个颜值高,5个颜值低,对应的考试成绩如下表(这个表叫做列联表,英文是contingency table):

image

零假设:颜值跟成绩无显著相关性。

为了知道能否拒绝零假设,我们下面做个Fisher精确检验(单边检验)

第一步:想知道零假设是否成立,就要看这组数据是不是随机偶然一抽就能抽到,因此我们计算零假设成立时,即颜值高与颜值低的人,高分低分的数量相同时,得到这样一组数据的超几何概率:

image.png

第二步:做完上面这一步还不够。如果行总数与列总数(又叫边际总数)不变,零假设不成立时的极端情况应该是,颜值高的学习都好!那么我们可以得到新的列联表:

image

这时,可以计算这个表格的超几何概率,

image.png

那么Fisher精确检验的P value就是两者加和ÿ

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