bsym是一个基本的python对称模块。它由描述配置向量空间、它们的对称操作和这些空间中对象的特定配置的核心类组成。该模块还包含一个用于处理^{}Structure对象的接口,以允许从对称的父晶体结构简单地生成无序对称的不等效结构。
示例在jupyter笔记本here中提供。
api文档是here。
源代码作为git存储库在https://github.com/bjmorgan/bsym上可用。
安装pip install bsym
或者从GitHub下载最新版本,然后安装cd bsym
python setup.py install
或者克隆最新的开发版本git clone git@github.com:bjmorgan/bsym.git
以同样的方式安装。cd bsym
python setup.py install
测试
自动测试最新提交发生在here。
手动测试可以使用python -m unittest discover
这些代码已经用python 3.5及更高版本进行了测试。
文档
api文档是可用的here。
我想生成一组对称的不等价晶体结构
bsym可以从pymatgenStructure对象描述的父结构开始,枚举由部分替换产生的对称不等价晶体结构。
示例代码位于example notebook.
另请参阅^{}文档。
引用bsym
此代码可引用为:
摩根,本杰明J.(2017)。bsym-基本对称模块。开源软件杂志。http://doi.org/10.21105/joss.00370
双键@article{Morgan_JOSS2017b,
doi = {10.21105/joss.00370},
url = {https://doi.org/10.21105/joss.00370},
year = {2017},
month = {aug},
publisher = {The Open Journal},
volume = {2},
number = {16},
author = {Benjamin J. Morgan},
title = {bsym: A basic symmetry module},
journal = {The Journal of Open Source Software}
}
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