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RSS订阅原创 [MacOS] 安装sshfs报错 ‘Error: ifuse has been disabled because it requires closed-source macFUSE!’
安装sshfs时报错
2022-08-18 17:16:41
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原创 【Python/图像处理】绘制二值图轮廓的N种方法
2D图像绘制轮廓1.cv2.findcontours()2.skimage.measure.find_contours()3.cv2.Canny()3D图像绘制表面1. 拆分成若干张2D图像, 使用2D方法2. skimage.measure.marching_cubes_classic...
2020-01-18 18:12:45
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原创 【Numpy】Numpy学习笔记(一)
以下是草稿1.from datatime import datatimestart = datatime.now和time.time()的差异?2.IPythonipython --pylab3.np.arange()可以创建一个0~n-1的数组4.数据类型bool 布尔类型int 整型float 浮点型complex 复数(复...
2019-12-22 20:17:32
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原创 【Python】当你需要计算1,000,000+次一维向量的相关系数, 怎么算最快(2)?
目录前景提要1.np.corrcoef的批量运算3.魔法操作3.结论前景提要可以看一下前一篇【Python】当你需要计算1,000,000+次一维向量的相关系数, 怎么算最快? 测试数据: (1000, 100) one of them (100,) 模板数据: (1000, 100) one of them (100,...
2019-12-05 12:10:58
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原创 【Python/Matlab】数据运算差异二三事
1.reshapematlab用的是 fortran order.(按列走,以最后一维为第一个循环,三维的话实际是 2,3,1)fortran order,fuc upython用的是c order(按行走, 以第一维为第一个循环 1,2,3)解决办法参数 order='F' (ps,相同的问题也会出在flatten里)2.stdmatlab默认算样本偏差(/n-1...
2019-12-03 19:45:38
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原创 【Python】当你需要计算1,000,000+次一维向量的相关系数, 怎么算最快?
背景最近需要用python计算大量的一维向量之间的相关系数, 其中: 测试数据: (1000, 100) one of them (100,) 模板数据: (1000, 100) one of them (100,)那么就需要计算1,000,000次相关系数,那么在这种情况下, 计算效率就变得很重要了.直接看提速好几百倍的升级版->...
2019-11-25 17:28:51
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原创 【Python】字典理解
目录初始化一个空字典给字典增加一对 键-值（key-value）使用键来调用值改变字典里的值字典是对象引用字典对键和值的迭代参考 初始化一个空字典 obj = {}print(obj)output:{} 给字典增加一对 键-值（key-value） 字典的键和值之间存在一一映射关系，且 键-值对 在字典中的放置是...
2019-10-14 18:27:56
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原创 【医学影像】如何无信息损失的读取、处理和保存nii文件（python，nibabel）
最近工作中需要解决一个问题：读取nii格式的医学图像，更改内部的矩阵，重新保存成nii数据但是Nifti数据本身是除了矩阵信息（也就是图像信息之外），还有和物理坐标相关的仿射矩阵以及Header头文件信息，但是nibabel的获取数据的方法get_data()是一个单向操作，只可以获取数据，并不能把数据直接存到一个现成的nii文件中，并没有诸如nii_img.data = new...
2019-09-16 16:56:12
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原创 【Ubuntu】【Python】shell cp和shutil.copy 用时小测试
新接手的代码有很多是用python来调用shell代码，看起来易读性比较差，还需要考虑参数、命令所在的环境位置等因素，考虑用python的模块来取代一部分shell命令，用最简单的copy测试了一下任务：复制同一个文件test.sh到本目录下的文件test2.shimport shimport timeimport shutiltic0 = time.time()shargs ...
2019-09-12 17:18:50
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原创 【FreeSurfer】mgz和nii.gz数据类型转换
使用freesurfer进行医学图像类型转换在使用freesurfer进行配准的过程中，需要数据格式为mgz，此时可以使用freesurfer内部命令进行数据类型转换#Shell 代码# mri_convert <ouput file> <input file>mri_convert T1.mgz T1.nii.gz......
2019-09-11 18:03:22
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原创 【ABee读论文】场景分割的双重注意力网络
【论文题目】Dual Attention Network for Scene Segmentation场景分割的双重注意力网络【期刊】CVPR2019【摘要】本文提出了一种基于自注意机制的场景分割方法。...
2019-09-09 17:02:30
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原创 【Ubuntu】 各种软件教程存档（MySQL、搜狗输入法、MATLAB）
目录Ubuntu18.04下安装MySQLUbuntu 18.04 搜狗输入法安装Ubuntu 18.04 MatlabR2014b安装Ubuntu18.04下安装MySQL重点：1.安装Mysqlsudo apt install mysql-server2.检查是否安装成功netstat -tap | grep mysql3.登录数据库mysql...
2019-09-09 15:52:24
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原创 【Ubuntu】如何酷炫的在Linux系统下使用多屏幕
命令行方法xrandr #查看设置xrandr --output eDP-1 --auto --primary #把笔记本的屏幕设为主屏幕xrandr --output DP-1 --left-of eDP-1 --auto #把分屏1设在主屏左边xrandr --output DP-2 --right-of eDP-1 --auto #把分屏2设在主屏右边xrandr --out...
2019-09-02 18:35:58
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原创 【ABee读论文】头部和颈部癌症危险器官和靶体积的自动分割的快速发展（Radiotherapy and Oncology，2019）
【论文题目】Rapid advances in auto-segmentation of organs at risk and target volumes in head and neck cancer头部和颈部癌症危险器官和靶体积的自动分割的快速发展【期刊】Radiotherapy and Oncology，2019（130-140）【摘要】准确描绘靶区和危及器官对...
2019-04-28 19:12:33
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原创 【Abee】吃掉西瓜——西瓜书学习笔记（七）
集成学习（ensemble learning）【内容包含 第八章】个体与集成集成学习一般是多个个体学习器以某种策略结合起来，其中的个体学习器可以是同质（homogeneous）的，成为“基学习算法”，也可以是异质（heterogenous）的，个体学习器成为组件学习器（component learner）。目前的集成学习主要分两类： 1.串行进行的序列化...
2019-04-26 19:17:56
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原创 【Abee】吃掉西瓜——西瓜书学习笔记（六）
贝叶斯分类器目录【内容包含 第七章】贝叶斯决策论（Bayes decision theory）极大似然估计（Maximum Likelihood Estimation，MLE）朴素贝叶斯分类器（naive Bayes classifier）半朴素贝叶斯分类器贝叶斯网道德图（moral graph）贝叶斯网学习贝叶斯网推断EM算法（Expectati...
2019-04-26 15:20:08
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原创 【Abee】吃掉西瓜——西瓜书学习笔记（五）
支持向量机（Support Vector Machine，SVM）目录【内容包含 第六章】间隔与支持向量核函数软间隔（soft margin）正则化(regularization)支持向量回归（Support Vector Regrassion,SVR）核方法间隔与支持向量分类学习的主要思想是在样本空间中找到一个划分超平面，将不同样本分开。超平面可...
2019-04-18 20:35:36
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原创 【Abee】吃掉西瓜——西瓜书学习笔记（四）
神经网络（neural networks）目录【内容包含 第五章】神经元模型感知器与多层网络多层前馈神经网络（multi-layer feedforward neural networks）反向传播算法（error BackPropagation，BP）BP算法解决过拟合的问题全局最小（global minimum）与局部极小（local minimum）...
2019-04-16 16:45:43
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原创 【Abee】吃掉西瓜——西瓜书学习笔记（三）
决策树（decision tree）目录【内容包含 第四章】基本流程信息增益（information gain）剪枝处理（pruning）连续值处理缺失值处理多变量决策树基本流程决策树（decision tree）基于树状结构进行判定，基本流程遵循“分而治之”（divide-and-conquer）策略。决策树基本流程作图好累（dogeA\{a*}...
2019-04-15 18:20:12
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原创 【Abee】吃掉西瓜——西瓜书学习笔记（二）
线性模型(linear model)目录【内容包含 第三章】线性回归（linear regression）多元线性回归（multivariate linear regression）对数几率函数（logistic function）线性判别分析（Linear Discriminant Analysis，LDA）多分类学习类别不平衡（clss-imbalance...
2019-04-15 14:47:01
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原创 【Abee】吃掉西瓜——西瓜书学习笔记（一）
绪论、模型评估与选择目录【内容包含 第一章、第二章】没有免费的午餐（No Free Lunch Theorem）过拟合（overfitting）与欠拟合（underfitting）几种模型验证方法模型评估的常见参数模型性能检验没有免费的午餐（No Free Lunch Theorem）所有学习算法的期望性能相同（只是处理不同的问题时，学习算法A优...
2019-04-11 10:59:58
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原创 箱线图（Box-plot / Box-whisker Plot）及Python-Matplotlib绘制
箱线图简介主要能够体现数据的分布，离散程度，及异常点Box -whisker PlotIQR (Interquartile range)：( IQR = Q3 - Q1 )Q1：第一四分数Q3：第三四分数MEDIAN：中位点OUTLIERS：异常值 异常值的判定为在（Q1 - 1.5 IQR, Q3 + 1.5 IQR）范围之外的点（即蓝色区域的点）whisk...
2019-04-02 15:20:48
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原创 虚拟机Linux下安装VMware Tools教程 （小白向）
昨天刚开始接触Linux，学习用VMware虚拟机安装ubuntu系统，发现在虚拟机中无法全屏，需要下载VMware Tools，官网教程 不太新手友好，就卡了一段时间，不过最后还是解决了~1.虚拟机安装Ubuntu系统下载 VMware软件，选择创建新的虚拟机一直下一步就好了，这里我选择的是稍后安装操作系统选择在喜欢的位置安装虚拟机即可设置完毕后，然后在虚拟机 CD/DVD选项中指向iso，安装...
2018-04-13 15:37:00
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原创 Win10下Python3.6+CUDA8.0+Tensorflow1.3.0环境配置体验
系统：Windows 10需要安装的软件 1. VS2017 2. Cuda 8.0 3. Cudnn 6.0 4. Anacond 31. Visual Studio 2017我下载的是免费IDE。2. Cuda 8.0需要提前检查驱动是否为最新版，否则可能会黑屏或安装失败。3. cuDNN 6.0需要注册一个账号，免费的。然后选择配套Cuda 8.0 的安装包。 4. ...
2018-04-12 14:32:20
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