![](https://img-blog.csdnimg.cn/20201014180756738.png?x-oss-process=image/resize,m_fixed,h_64,w_64)
文献复现
文章平均质量分 58
平淡的牛马
这个作者很懒,什么都没留下…
展开
-
生信文章复现学习 PMID:36898287(三)
本文仅做logistic回归分析构建的列线图部分,其余部分已经很简单,包括DCA曲线 ROC曲线 相关性棒棒糖图,已经有不少教程,而且箱式图等也不难。因此不再进一步做了。原创 2023-11-18 11:11:27 · 139 阅读 · 1 评论 -
生信文章复现学习 PMID:36898287(二)
上文复现了DEG和WGCNA之后,与原文章有出入,最后我借用sangerbox工具取交集,选出210个gene进行LASSO和SVM分析,继续筛选核心基因,其实可以使用更多的机器学习办法,如随机森林和Xgboost。LASSO回归结果和原文差别不小,我注意到原文四个基因都在那210个基因中,但是LASSO只选出了6个,其中只有2个基因和原文一致,LASSO具体参数尚不清楚。取前38个基因和LASSO取交集,只有SOCS2和FOSB和原文一致,SVM估计参数也不一样,恳请指正。原创 2023-11-12 15:45:29 · 784 阅读 · 12 评论 -
生信文章复现学习 PMID:36898287(一)
文章学习,并尽量复现文章。原创 2023-11-09 22:17:04 · 670 阅读 · 5 评论