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原创 批量下载基因的蛋白质氨基酸序列

前提:有一批基因(有基因名,转录本编号:NM_xxxx.x,UniprotID),需要下载这些基因的蛋白质氨基酸序列。过程:1.根据基因名以及搜索NM编号,可以在NCBI-Gene数据库中NM编号找到对应的NP编号,点击NP编号链接,转到下载氨基酸fasta序列页面。这是下载单个基因的蛋白质序列。2.这些基因,根据NM编号逐个按照1的方式,查询并记录其对应的NP编号(NM与 NP一一对应的信息,是否能从某数据库中获取?)Uniprot数据库中,可以通过UniprotID批量获取其NP编号(R

2022-02-10 15:20:41 10301

原创 R安装软件包报错-2

> install.packages('clusterProfiler')Warning in install.packages : package ‘clusterProfiler’ is not available for this version of RA version of this package for your version of R might be available elsewhere,see the ideas athttps://cran.r-pro.

2022-02-08 13:14:37 2981

原创 Windows电脑上新安装R/Rstudio上安装软件包时报错-1

install.packages("ggplot2")报错:R install.packages unable to access index for repository https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/src/contrib: cannot open URL 'https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/src/contrib/PACKAGES'解决方案:1. 尝试更换所有国内镜像,并取消使用HTTP下载和使用IE浏览器下载Rs

2022-02-08 11:24:06 603

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