R安装软件包报错-2

> install.packages('clusterProfiler')

Warning in install.packages :

  package ‘clusterProfiler’ is not available for this version of R

A version of this package for your version of R might be available elsewhere,

see the ideas at

https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-patched/R-admin.html#Installing-packages

Bioconductor - clusterProfiler

clusterProfiler包需要用BiocManager安装

报错:

> BiocManager::install('clusterProfiler')

Error: Bioconductor version cannot be validated; no internet connection?

上篇文章中在Rprofile.site文件中增加options(download.file.method = 'libcurl'),解决了R自带软件包的下载问题。但用BiocManager仍然提示联网错误。

解决办法:

先运行options(url.method='libcurl')或者在Rprofile.site文件中增加options(url.method='libcurl'),则使用BiocManager下载软件包成功。

参考资料:

BiocManager无法安装R包 - 云+社区 - 腾讯云

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