R - Boxplots（R简单制作箱形图）

最新推荐文章于 2024-04-12 09:50:18 发布

沙漠生信客栈

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R - Boxplots（R简单制作箱形图）

箱线图是衡量数据集中数据分布情况的指标。它将数据集分为三个四分位数。该图表示数据集中的最小值，最大值，中值，第一四分位数和第三四分位数。通过为每个数据集绘制箱线图来比较数据集之间的数据分布也很有用。

语法：

boxplot(x, data, notch, varwidth, names, main)

下面是使用R的描述参数：

x 是一个向量或者一个公式
data 是一个数据框
notch 是一个逻辑值。设置为TRUE以绘制凹槽
varwidth 是一个逻辑值。设置为true，绘制与样本量成比例的框宽
names 是组标签，将打印在每个箱线图下
main 用来给图形一个标题

事例：

我们使用R环境中可用的数据集mtcars来创建基本的箱线图。让我们看看mtcars中的“mpg”和“cyl”列：

library(ggplot2)
#导入ggplot2包
input <- mtcars[,c('mpg','cyl')]
#选取原始数据的两列
print(head(input))

首先要想知道上面的数据，看看原始数据集吧：

> mtcars
                     mpg cyl  disp  hp drat    wt  qsec vs am gear carb
Mazda RX4           21.0   6 160.0 110 3.90 2.620 16.46  0  1    4    4
Mazda RX4 Wag       21.0   6 160.0 110 3.90 2.875 17.02  0  1    4    4
Datsun 710          22.8   4 108.0  93 3.85 2.320 18.61  1  1    4    1
Hornet 4 Drive      21.4   6 258.0 110 3.08 3.215 19.44  1  0    3    1
Hornet Sportabout   18.7   8 360.0 175 3.15 3.440 17.02  0  0    3    2
Valiant             18.1   6 225.0 105 2.76 3.460 20.22  1  0    3    1
Duster 360          14.3   8 360.0 245 3.21 3.570 15.84  0  0    3    4
Merc 240D           24.4   4 146.7  62 3.69 3.190 20.00  1  0    4    2
Merc 230            22.8   4 140.8  95 3.92 3.150 22.90  1  0    4    2
Merc 280            19.2   6 167.6 123 3.92 3.440 18.30  1  0    4    4
Merc 280C           17.8   6 167.6 123 3.92 3.440 18.90  1  0    4    4
Merc 450SE          16.4   8 275.8 180 3.07 4.070 17.40  0  0    3    3
Merc 450SL          17.3   8 275.8 180 3.07 3.730 17.60  0  0    3    3
Merc 450SLC         15.2   8 275.8 180 3.07 3.780 18.00  0  0    3    3
Cadillac Fleetwood  10.4   8 472.0 205 2.93 5.250 17.98  0  0    3    4
Lincoln Continental 10.4   8 460.0 215 3.00 5.424 17.82  0  0    3    4
Chrysler Imperial   14.7   8 440.0 230 3.23 5.345 17.42  0  0    3    4
Fiat 128            32.4   4  78.7  66 4.08 2.200 19.47  1  1    4    1
Honda Civic         30.4   4  75.7  52 4.93 1.615 18.52  1  1    4    2
Toyota Corolla      33.9   4  71.1  65 4.22 1.835 19.90  1  1    4    1
Toyota Corona       21.5   4 120.1  97 3.70 2.465 20.01  1  0    3    1
Dodge Challenger    15.5   8 318.0 150 2.76 3.520 16.87  0  0    3    2
AMC Javelin         15.2   8 304.0 150 3.15 3.435 17.30  0  0    3    2
Camaro Z28          13.3   8 350.0 245 3.73 3.840 15.41  0  0    3    4
Pontiac Firebird    19.2   8 400.0 175 3.08 3.845 17.05  0  0    3    2
Fiat X1-9           27.3   4  79.0  66 4.08 1.935 18.90  1  1    4    1
Porsche 914-2       26.0   4 120.3  91 4.43 2.140 16.70  0  1    5    2
Lotus Europa        30.4   4  95.1 113 3.77 1.513 16.90  1  1    5    2
Ford Pantera L      15.8   8 351.0 264 4.22 3.170 14.50  0  1    5    4
Ferrari Dino        19.7   6 145.0 175 3.62 2.770 15.50  0  1    5    6
Maserati Bora       15.0   8 301.0 335 3.54 3.570 14.60  0  1    5    8
Volvo 142E          21.4   4 121.0 109 4.11 2.780 18.60  1  1    4    2

再看看input所输出的数据吧：

> input
                     mpg cyl
Mazda RX4           21.0   6
Mazda RX4 Wag       21.0   6
Datsun 710          22.8   4
Hornet 4 Drive      21.4   6
Hornet Sportabout   18.7   8
Valiant             18.1   6
Duster 360          14.3   8
Merc 240D           24.4   4
Merc 230            22.8   4
Merc 280            19.2   6
Merc 280C           17.8   6
Merc 450SE          16.4   8
Merc 450SL          17.3   8
Merc 450SLC         15.2   8
Cadillac Fleetwood  10.4   8
Lincoln Continental 10.4   8
Chrysler Imperial   14.7   8
Fiat 128            32.4   4
Honda Civic         30.4   4
Toyota Corolla      33.9   4
Toyota Corona       21.5   4
Dodge Challenger    15.5   8
AMC Javelin         15.2   8
Camaro Z28          13.3   8
Pontiac Firebird    19.2   8
Fiat X1-9           27.3   4
Porsche 914-2       26.0   4
Lotus Europa        30.4   4
Ford Pantera L      15.8   8
Ferrari Dino        19.7   6
Maserati Bora       15.0   8
Volvo 142E          21.4   4
>

head表示看看前面几行吧（一般指前6行）：

> print(head(input))
                   mpg cyl
Mazda RX4         21.0   6
Mazda RX4 Wag     21.0   6
Datsun 710        22.8   4
Hornet 4 Drive    21.4   6
Hornet Sportabout 18.7   8
Valiant           18.1   6

创建箱线图

下面的脚本将为mpg(英里每加仑)和cyl(气缸数)之间的关系创建一个箱线图：

library(ggplot2)

input <- mtcars[,c('mpg','cyl')]
print(head(input))

# Plot the chart.
boxplot(mpg ~ cyl, data = mtcars, xlab = "Number of Cylinders",
        ylab = "Miles Per Gallon", main = "Mileage Data")

得到图像为：

在这里插入图片描述

有缺口的箱线图

可以用notch绘制箱线图，找出不同数据组的中位数是如何相互匹配的；
下面的脚本将为每个数据组创建一个带有凹槽的箱线图：

library(ggplot2)
input <- mtcars[,c('mpg','cyl')]
print(head(input))
# Plot the chart.
boxplot(mpg ~ cyl, data = mtcars, 
        xlab = "Number of Cylinders",
        ylab = "Miles Per Gallon", 
        main = "Mileage Data",
        notch = TRUE, 
        varwidth = TRUE, 
        col = c("green","yellow","purple"),
        names = c("High","Medium","Low")
)

结果呈现为：

在这里插入图片描述

声明：本文基于参考文摘进行编辑
本文编辑：魏博；何熠；刘玉凤；丁锡旭；李飘飘；李全芬
微信ID: lxdlxd19900511
联系邮箱：
1026472070@qq.com
1029454784@qq.com
1441958443@qq.com
lxdlxd19900511@163.com
qskong@mail.hzau.edu.cn
参考文摘：
1.R语言官方文档
2.https://www.tutorialspoint.com/r/r_boxplots.htm

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