weixin_41492161的博客

原创 web制作

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原创 jupyter链接服务器

【代码】jupyter链接服务器。

原创 基于Seurat包对标签进行修改

基于Seurat包对标签进行修改便于绘制图片和进行分析mydata <- RunPCA(mydata, assay = "SCT", verbose = FALSE)mydata <- FindNeighbors(mydata, reduction = "pca", dims = 1:30)mydata <- FindClusters(mydata, verbose = FALSE)mydata <- RunUMAP(mydata, reduction = "pca", di

原创 umap降维并使用ggplot绘图

df_umap=read.csv("D:/pbmc0001/test2/1.csv",header = F)lab=read.csv("D:/pbmcbatlab.csv",header = F)df_umap=t(df_umap)umap <- umap(df_umap,method='naive',n_neighbors = 5)head(umap$layout)str(umap$layout)str(lab)View(lab)View(umap$layout)umap_df

原创 Tensorflow正规安装方式

anacondon安装tensorflow过程举例添加国内镜像conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/conda config --set show_channel_urls yes创建一个环境con

原创 用R语言foreach包对某个函数进行并行的实例

library("httr") library("jsonlite")library("magrittr")GETPDF <- function(i){ url<-"https://index.toutiao.com/api/report" headers<-c( "Host"="index.toutiao.com", "User-Agent"="Mozilla/5.0 (Windows NT 10.0; WOW64) AppleWebK

原创 R语言后台运行linux

Rscript try.R &>nohup.out&

原创 R包下载问题解决1

factoextra包解决windows情况下# 清空环境rm(list=ls())# 安装包并加载包# 使用k-means聚类所需的包：factoextra和cluster site="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN"package_list = c("factoextra","cluster")for(p in package_list){ if(!suppressWarnings(suppressMessages(require

原创 github管理查找文件

In:name spring bootin:name spring boot stars:>500in:readme R stars:>500in:description R language:R pushed:>2017

原创 windows网络重新配置

netsh winsock reset

原创 R语言的知识的那些坑2

#绘制3D图像Express=read.table(“E:/atom.txt”,header=TRUE,sep =",",stringsAsFactors = FALSE,quote = “”)library(scatterplot3d)library(rgl)plot3d <- with(Express, scatterplot3d(X, Y, Z, color =group,pc...

原创 测序软件使用1

less sequences.fasta 显示数据集的数据source ~/.bashrc 加载当地的环境路径echo $PATH 显示路径conda install bwa 安装bwa软件工具llmkdir index 创建文件夹mv vi.* index/ 将带有vi的存入index文件...

原创 R语言画图1

ggplot(Express, mapping = aes(x=X, y=Y,col = clustering))+geom_point(size = 0.5,alpha=0.7)+scale_color_gradient(‘clustering’, low = “red”, high = “blue”)Expressclustering=factor(Expressclustering=fac...

原创 R语言的知识的那些坑1

#统计每行表达的百分比#>0表现>0的占的百分比for (i in 1:30) {print(mean(Express[i,]>0))}for (i in 1:nrow(Express)) {print(mean(Express[i,]>0))}#数据每行显示不为0的个数x=e[[“gt0”]]<-Reduce(’+’,as.data.frame(e...

原创 SCANPY代码部分调试整理1

最近刚刚调通了一个R语言和matlab的源码，相比于现在调的python感觉还是R比较简单，现在只调通了python源码一部分，整理一下SCANPY代码的核心算法包括：Louvain算法，Louvain算法是一种基于多层次优化Modularity的算法，它的优点是快速、准确，被认为是性能最好的社区发现算法之一。主要调试这个算法算法源码链接：https://github.com/vtraag/lo...

原创 matlab笔记1

doc plot 显示plot文档clc 清空界面数据format compact 简化输出语句format loose 恢复复杂局域几个图像函数logoearthmappennytravelfifteenteapotdemo

原创 git 上传项目

https文件传输方法1.首先在github注册一个账号2.然后登陆账号3.登陆后的界面4.然后创建一个放置项目的仓库在这里插入图片描述5.将要导入的文件放在一个文件夹中注意不可以有.git文件5.执行bash语句...

原创 sourcetree上传文档

1.新建分支拉分支2.选择对应的名称3.检出分支4.删除master

原创 工艺整理

原创 webpack4.39与react搭建(2)

https://blog.csdn.net/userkang/article/details/83381285webpack 4：用 Babel 7 转译 ES6 的 js 代码现在大家都习惯用 ES6 写 Javascript。但是不是所有浏览器都知道怎么处理 ES6。我们需要做一些转换。这个转换的步骤叫做 transpiling。transpiling 是指把 ES6 转译成浏览器能够...

原创 webpack4.39与react搭建(1)

创建一个目录然后进入mkdir webpack-4-quickstart && cd $_初始化 package.json：npm init -y安装 webpack4：npm i webpack --save-dev还需要安装另外一个包：webpack-clinpm i webpack-cli --save-dev然后打开 package.json 添加构建脚本...

原创 硬件知识整理

vga口有的先没有用 比如地线一般来说是这样驱动板示意图：显示器 由屏幕和驱动板组成注意需要屏幕的分辨率和驱动板分辨率一致注意数据线是否在买驱动板时带来触摸屏需要驱动板和数据线需要驱动板的变压器 和驱动板是否有音频出口...

原创 React安装 环境搭建

1.安装nodejs首先要安装nodejs，可以直接到node官网下载安装。安装完成后，打开cmd ，输入node -v 查看是否安装 。npm工具也会随node一起自动安装，使用npm -v 查看。配置成功后就可以开启webstorm项目了。（存微信收藏、、）1：在webstorm下配置node环境：2：完成之后：React官方脚手架地址：https://github.com/...

原创 tensorflow安装

https://blog.csdn.net/u014552678/article/details/62046638打开Windows的cmd，在cmd中输入jupyter notebook --generate-config如下图：可以看到路径为D:\Users……找到此路径修改jupyter_notebook_config.py文件c.NotebookApp.notebook_dir =...

原创 ubuntu和Windows双系统安装

五步完美实现 Win10 + Ubuntu 17.04 双系统启动网络上各种双系统安装的教程良莠不齐，大多相互抄袭，很容易让人对 Linux“敬而远之”，其实并没有那么难，本文去繁从简，简单而又清晰地介绍如何在 Windows 10 下五个步骤完美实现 Win10 + Ubuntu 17.04双系统启动。需要注意一点的是，现在大多数计算机都拥有固态和机械两块硬盘，Windows 一般安装在固...

原创 ssm框架搭建

1.idea新建maven项目，注意点击webapp选项2.idea 写pom文件内容3.新建resource的jdbc连接4.下载maven文件5.配置tomcat