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算法
oriRNA
这个作者很懒,什么都没留下…
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基因表达相关性——笔记
皮尔森相关和斯皮尔曼等级相关,通过计算不同基因表达量的相关系数,来构建基因共表达网络;怎么分析和展示RNAseq基因表达数据中基因的相关性;散点图矩阵显示样本之间的相关性,”YaleToolkit”包,用里面的gpairs()函数是最简单的;基于统计相关性与K-means的区分基因子集选择算法,选择具有高区别能力的基因不仅提高疾病分类识别和预测的准确率\,降低疾病诊断时间,减少临床诊断费用,并可促...原创 2018-05-07 15:59:03 · 17452 阅读 · 0 评论 -
组学联合分析
转录组学-蛋白质组学联合分析mRNA与蛋白质均存在的基因将基于参考基因得到的蛋白质鉴定结果与转录组结果进行关联分析,用于验证mRNA可变剪接。当某一个蛋白被鉴定到且在转录组水平有表达信息时,被认为关联到。相关性分析将在蛋白水平和转录水平关联到的所有可定量数据进行关联分析,计算Pearson相关系数,得到蛋白和 mRNA表达的相关性,并在相关分析中,按照蛋白和mRNA表达量的变化将关联分析分成4类,...原创 2018-05-07 16:11:24 · 7843 阅读 · 0 评论 -
医学统计学中RR、OR和HR三个关于比值的概念
在医学统计学中,有三个关于比值的概念,分别为相对危险度(relative risk,RR,也称 risk ratio)、风险比(hazard ratio,HR)和优势比(odds ratio,OR)。很多同行一看见这三个概念就容易混绕。在此,笔者拟谈谈如何正确理解这三个概念的区别和联系。目录RR(Relative Risk) - 相对危险度OR(Odd Ratio) - 比值比HR...原创 2019-07-13 18:29:34 · 172758 阅读 · 15 评论 -
R语言计算医学统计学中RR、OR和HR三个关于比值
计算队列研究的相对风险度(Calculating Relative Risks for a Cohort Study)生物医学统计数据中一种非常常见的数据集是一项队列研究,在这项研究中,您可以了解接触某些治疗或环境的人(例如,服用某种药物的人或吸烟的人)以及是否同样的人有特定的疾病。您的数据集看起来像这样: Disease Control Exposed 15...原创 2019-07-13 18:39:05 · 20485 阅读 · 2 评论