linux
随风而逝*
生物信息行业新手,记录一下学习过程。希望能帮到大家
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使用anaconda安装出现:PackagesNotFoundError: The following packages are not available from current channels
使用conda安装软件的时候出现下图报错:解决办法:1.首先找到 这个软件的版本信息:anaconda search -t conda X ## X表示软件2.然后安装你需要的版本的软件:conda install -c https://conda.anaconda.org/X ## X表示具体软件路径例如:conda install...原创 2020-01-07 16:55:10 · 7818 阅读 · 2 评论 -
为什么每次打开一个新的shell都要重新source一下.bashrc
为什么每次打开Xshell终端,都要source一下.bashrc?为了弄明白这个问题,首先,我们需要搞明白Linux启动时读取配置文件的顺序。在刚登录Linux时,首先启动/etc/profile 文件,然后再启动用户目录下的 ~/.bash_profile、~/.bash_login或 ~/.profile文件中的其中一个,执行的顺序为:~/.bash_profile、~/.bas...转载 2020-01-02 14:23:10 · 4297 阅读 · 0 评论 -
服务器的环境变量配置。
1.在自己的bashrc上写入下面的代码,可以看着舒服点。PS1="\[\033[0;32m\]\A \[\033[0;31m\]\u\[\033[0;34m\]@\[\033[0;35m\]\h\[\033[0;34m\]:\[\033[00;36m\]\w\[\033[0;33m\] \n$\[\033[0m\]"记得source ~/.bashrc2.一些快捷键的设置。例如...原创 2019-01-24 17:08:05 · 3738 阅读 · 0 评论 -
shell脚本添加时间,crontab的使用规范。
1.给shell脚本里面加入时间。d=`date +%Y-%m-%d`echo -e "当前时间:$d" >>time.txt2.crontab的简单使用。cat /etc/crontab #查看crontab,输出如下所示SHELL=/bin/bashPATH=/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/binMAILTO=root# Fo...原创 2019-01-23 16:34:28 · 1964 阅读 · 0 评论 -
简单的merge fastq的小脚本
1.针对目录下的许多个fastq文件,现在需要每10个fastq合并成一个新的fastq文件。具体的shell脚本如下:c=($(cat fastq.list)) #当前目录下fastq文件相对路径的列表a=$1 #fastq文件所在的文件路径mkdir pass #建立输出文件夹b=`ls ${a}/*q |wc -l` ...原创 2019-04-07 22:24:22 · 2861 阅读 · 0 评论 -
linux常用小命令——持续更新ing
sed 3~2d merge.txt ##从第三行开始每隔一行删除一行awk '$0=FILENAME$0' frequency.txt | less##文件内部加入文件名awk -F "\t" '{print NF }' reshape.txt |sort -u######查看文件的列数cut -b #仅显示行中指定直接范围的内容; -d #指定字段的分隔符,默认的字段...原创 2019-04-12 18:27:26 · 402 阅读 · 1 评论 -
ulimit -n 用来设置同一时间最多可以开启的文件数
ulimit -a 用来显示当前的各种用户进程限制Linux对于每个用户,系统限制其最大进程数,为提高性能,可以根据设备资源情况,设置个Linux用户的最大进程数,一些需要设置为无限制:数据段长度:ulimit -d unlimited最大内存大小:ulimit -m unlimited堆栈大小:ulimit -s unlimited我们在用这个命令的时候主要是为了产生core文件,就...转载 2019-04-18 09:41:53 · 1183 阅读 · 0 评论 -
使用ncdu分析linux中磁盘使用情况
1.ncdu的安装。sudo apt updatesudo apt install ncdu #ubuntu的软件源里面就有cd /usr/local/ wget https://dev.yorhel.nl/download/ncdu-1.9.tar.gztar zxvf ncdu-1.12.tar.gz cd ncdu-1.12/./configure --prefi...原创 2019-05-10 14:32:51 · 602 阅读 · 0 评论 -
linux下使用conda命令报错解决办法
1.在服务器上使用conda创建一个虚拟环境的时候报错信息如下:conda create -y --name deepsignalCollecting package metadata: doneSolving environment: doneUnavailableInvalidChannel: The channel is not accessible or is invalid...原创 2019-05-17 09:04:21 · 3451 阅读 · 0 评论