WRF安装记录

WRF安装

虚拟机 Ubuntu 22.04.1 LTS

aptitude，类似apt-get，但功能更强大

sudo apt-get install aptitude

WRF基础依赖软件及库安装（apt-get一键安装）

安装编译器 （ #编译c,c++,fottran语言统一使用一套编译器，使用gun系列，对应gcc,g++，gfortran,使用intel系列，对应icc,i++,ifort，或者使用pgi系列对应的。编译wrf和netcdf等要使用同一套系列，否则容易出错，此次使用gun系列）

sudo apt-get install gcc g++ gfortran

sudo apt-get install make

安装WPS需要的库libpng，zlib，jasper

sudo apt-get install libpng12*

sudo apt-get install zlib*

sudo apt-get install libjasper-dev

安装libjasper-dev报错

解决方法：添加源

sudo add-apt-repository "deb http://security.ubuntu.com/ubuntu xenial-security main"

sudo apt update

sudo apt install libjasper1 libjasper-dev

缺少公钥报错：

打开终端，下载公钥：

sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys 40976EAF437D05B5

PS：后面那个40976EAF437D05B5换成缺少的密钥，是什么就换成什么

安装用于并行的mpich

sudo apt-get install mpich

安装用于图形显示的

sudo aptitude install xorg-dev

安装另外的shell语言

sudo apt-get install csh

sudo apt-get install ksh

安装m4,暂时不知道用于啥，还没具体查

sudo apt-get install m4

HDF5与NECTCDF（手动编译安装）

前期准备，可以先设置HDF5和NETCDF的环境变量
例如把hdf5与netcdf安装在/home/zzy/app这个目录
在这两个目录建立hdf5和netcdf文件夹

mkdir hdf5
mkdir netcdf

设置环境变量

gedit ~/.bashrc

在文件中添加这些内容

export APP_DIR=$HOME/app #app这个目录用的频繁，给设置一个环境变量
export NETCDF=$APP_DIR/netcdf #设置netcdf的环境变量
export HDF5=$APP_DIR/hdf5
export PATH=$PATH:$NETCDF/bin:$HDF5/bin #在PATH后面加上netcdf和hdf5的bin路径
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$NETCDF/lib:$HDF5/lib
#在 LD_LIBRARY_PATH后面加上netcdf和hdf5的lib路径

(PATH和LD_LIBRARY_PATH都是系统有的环境变量，新安装软件，在他们后面加上对应的bin和lib路径就可)

修改完后，保存退出
执行 .bashrc脚本，使刚才设置的环境变量生效

source ~/.bashrc

HDF5下载:https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/

NETCDF下载：https://www.unidata.ucar.edu/downloads/netcdf/

HDF5

./configure --prefix=$HDF5 CC=gcc FC=gfortran CXX=g++ --enable-fortran --enable-fortran2003 --enable-cxx
make #(或者make -j 4 并行编译，4线程，线程数可根据自己的电脑选择)
make install

注解：–prefix=$HDF5, $HDF5是安装hdf5的路径，换成自己的

NETCDF

NetCDF高版本的C\C++\Fortran部分需要分开编译
先装C版本

./configure --prefix=$NETCDF CC=gcc FC=gfortran F77=gfortran CXX=g++ CPPFLAGS="-I$HDF5/include" LIBS="-L$HDF5/lib"
make #（或者make -j 4 # 并行编译，4线程，线程数可根据自己的电脑选择）
make check (可忽略)
make install

再装Fortran版本

./configure --prefix=$NETCDF CC=gcc FC=gfortran F77=gfortran CXX=g++ CPPFLAGS="-I$NETCDF/include" LIBS="-L$NETCDF/lib"
make #（或者make -j 4 # 并行编译，4线程，线程数可根据自己的电脑选择）
make check (可忽略)
make install

注解：$NETCDF是netcdf的路径，换成自己的

WRF与WPS

下载WRF和WPS，解压后，WRF和WPS一定要在同一个父目录

也可以用git clone(需要先安装git)

git clone --recurse-submodules https://github.com/wrf-model/WRF

git clone https://github.com/wrf-model/WPS

WRF

定位到WRF文件夹，终端中运行

./configure

根据使用的配置，即GNU编译器（gfortran/gcc）+ dmpar（mpich）选择33选项（34编译不成功，还不知道原因）。

serial 表示串行计算；
smpar 表示内存共享并行计算(shared memory option)，即使用openMP，大部分多核电脑都支持这项功能；
dmpar 表示分布式并行计算(distributed memory option)，即使用MPI 进行并行计算，主要用在计算集群，单个电脑就没必要用了；
dm+sm 表示同时使用openMP与MPI两种并行方式.

嵌套方式：选择1，即基础嵌套即可。​​​​​​​

若出现错误：

因为ubuntu默认的sh是连接到dash的，又因为dash跟bash的不兼容所以出错了，执行时可以把sh换成 ’ bash 文件名.sh ’ 来执行，成功。
修改sh默认连接到bash的一种方法：

sudo dpkg-reconfigure dash

选择no 即可！

export J="-j 4" #设置并行编译的环境变量J ,4是核数，根据机器选（字面上设置的是核数，实际是线程）

./compile em_real >& compile_wrf.log

编译类型有以下几种
WRF-Chem（WRF大气化学模型）
em_real （3D真实情况）
em_quarter_ss （3D理想的情况下）
em_b_wave （3D理想的情况下）
em_les （3D理想的情况下）
em_heldsuarez （3D理想的情况下）
em_tropical_cyclone （3D理想的情况下）
em_hill2d_x （2D理想的情况下）
em_squall2d_x （2D理想的情况下）
em_squall2d_y （ 2d理想情况）
em_grav2d_x （2d理想情况）
em_seabreeze2d_x （2d理想情况）
em_scm_xy （1d理想情况）

真实情况编译完成后，在main目录下会出现ndown.exe,real.exe, tc.exe, wrf.exe这4个可执行程序；理想情况编译后会生成wrf.exe，ideal.exe 这2个可执行程序。

ls main/*exe # 出现 ndown.exe real.exe tc.exe wrf.exe即成功

WPS

先编译WRF，再编译WPS
WPS要和WRF在同一个父目录下
定位到WPS目录，终端执行：

./configure

选择1

./compile>& complie_wps.log
ls *exe # 出现geogrid.exe  metgrid.exe  ungrib.exe即成功

出现问题：编译后只生成了ungrib.exe。
解决方法：
修改./configure生成的configure.wps文件：
将“-lgomp”添加到configure.wps文件WRF_LIB变量中（只需将其附加到 -lnetcdf 之后）

重新执行

./compile>& complie_wps.log

生成geogrid.exe metgrid.exe ungrib.exe，完成！