读取excel显示错误_R包readxl 的libxls读错误的解决方法

R包readxl 的libxls读取错误解决方法

缘起：xls转化为xlsx

CCK8和MTT实验完成后，需要进行数据分析，自然而然想到用R批量处理。结果xls文件不能被readxl包打开。

read_xls('bad.xls')Error:   filepath: bad.xls  libxls error: Unable to open file

千辛万苦安装了各种读取xls的R包，一一失败，不能解决问题

笨且有效的办法

用wps或office打开xls，然后另存为xlsx即可。如果有二三十个文件要转换，很容易出错。一个小技巧是打开所有文件xls后，一个一个另存为xlsx。windows下要注意设置显示文件扩展名。

linux下正确的打开方式

linux下当然考虑用命令行转换。费了半天时间，终于在SO上看到一个回答，用ssconvert的命令成功将xls文件转化为xlsx格式

sudo pacman -S gnumericssconvert bad1.xls good1.xlsx

批量转化

ls *xls | xargs -i ssconvert {} {}.xlsx

不正确的打开方式

libreoffice转化后有问题，打开xlsx文件，发现3个sheet会变1个sheet 同时乱码

sudo pacman -S libreofficelibreoffice --convert-to xlsx  bad.xls

soffice --headless --convert-to xls --outdir converted *xls

坏的xls格式文件

绝大部分xls文件都能被readxl包正确读取，现在遇到的xls文件都是检测仪器的软件Varioskan产生的。用excel软件呢能打开能读取，但是不能修改写入，比如不能求均值。也许是宏安全的问题。很是不方便。