在igraph或networkx中,在稀疏有向图中找到长度为4的所有简单路径的最快方法是什么?一种方法是制作长度为4的简单路径的图形并使用子图同构vf2函数.这是最好/最快的方式吗?
我没有源节点,我想在整个图中存在长度为4的所有简单路径.
在我的数据中,可能很少有这样的路径,我希望能够有效地迭代它们.
解决方法:
使用这样的函数:
def simple_paths(start, length, visited=[]):
if length==0:
yield(visited + [start])
else:
for child in children(start):
if child not in visited:
for path in simple_paths(child, length-1, visited + [start]):
yield(path)
您可以通过调用列出长度为4的所有简单路径
for start in nodes():
for path in simple_paths(start, 4):
print path
上面假设nodes()返回图中所有节点的可迭代,并且children(x)返回节点x的子节点的可迭代.
将simple_paths()函数正确应用于上图可以得到:
['5', '9', '3', '1', '0']
['6', '5', '9', '3', '1']
['6', '5', '3', '1', '0']
['9', '5', '3', '1', '0']
这证明了这个功能:
>尊重有向边(例如,它不选择[‘6′,’5′,’1′,’3′,’9’])
>只选择简单路径(例如,它不选择[‘6′,’5′,’3′,’1′,’5’])
标签:python,algorithm,networkx,igraph
来源: https://codeday.me/bug/20190517/1121821.html