Wassfast操作流程

Wassfast在Linux下运行过程

1. 安装conda或者miniconda
2. 下载Wassfast，安装git
   $ sudo apt-get install git
   $ git clone https://gitlab.com/fibe/wassfast.git
   $ cd wassfast
3. conda env create -f environment_name
   environment_name 根据安装的环境选择
   如果conda安装失败，选择mamba进行安装
   $ conda install -n base conda-forge::mamba
   $ mamba env create -f environment_name
4. 如果使用PU模式运行，需要编译C++库
   $ cd wassfast/PointsReducer
   $ mkdir build
   $ cd build
   $ cmake …/
   $ make ; make install
5. 激活环境
   $ conda activate wassfast_cnn
   $ python -m wassfast ./input /home/tai/desktop/wassfast/data/config256.mat ./config ./settings.cfg RLTB CNN --batchsize 16 -n 49 -r 15.0 -o output.nc
6. 在wassfast文件夹下下载数据并解压，激活环境后运行
   $./run_wassfast_cnn.sh
   如果报错 only integers, slices (:), ellipsis (...), and 1-d integer or boolean arrays are valid indices
   在终端输入 export PYTHONWARNINGS=‘ignore:semaphore_tracker:UserWarning’
7. 生成wassfast_output.nc后在数据文件夹下运行
   $./run_wassncplot.sh
   报错
   DirectoryNotACondaEnvironmentError: The target directory exists, but it is not a conda environment.
   Use ‘conda create’ to convert the directory to a conda environment.
   target directory: /home/tai/miniconda3/envs/wassncplot
   不知道什么原因，等解决了再更新。