qsub 指定节点_科学网—PBS查看空闲节点命令 - 叶小球的博文

最新推荐文章于 2023-11-24 16:32:59 发布
最新推荐文章于 2023-11-24 16:32:59 发布
阅读量3k 收藏 3
点赞数
文章标签： qsub 指定节点
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_42429893/article/details/114467824
版权

第一:用好查看空闲节点命令。open PBS 查看空闲节点命令：pbsnodes -l free.

如果你的程序具有很好的可扩展性，那么你马上就设置需要的CPU的数量进行计算，而不是盲目设置CPU的数量。如果设置的少了，程序运算的慢了，如果设置的多了，就要排队等CPU，浪费时间。

第二：查看队列。open PBS查看队列的命令：qstat -a，该命令可以查看各个队列的排队情况，还可以看到正在运行的程序的运行时间。看看各个队列的排队情况，那个队列短，提交到哪个队列计算，往往有事半功倍的效果。

有些时候明明空闲CPU数量是够的，但自己提交的作业就是不运行。这可能是已经有别人提交了作业，系统在等候资源。这时你不妨把自己的作业的运行时间缩短一下，再次提交，说不定你就插队成功了。

现在应该就可以使用如ssh node1(你给各个节点取的名字)直接登录到分节点上，而不提示输入用户名和密码

qsub：此命令是向PBS提交你的任务。 Qdel：此命令是删除PBSd的作业。 qstat [-n]：显示当前作业状态和关联的节点。 pbsnodes [-a]：显示节点的状态

转载本文请联系原作者获取授权，同时请注明本文来自叶小球科学网博客。

链接地址：http://blog.sciencenet.cn/blog-567091-721448.html

上一篇：径向分布函数与histogram程序分析-永远的Vanessa

下一篇：声子谱出现虚频-解决方案摘录

杯子没水
关注
  • 0
    点赞
  • 踩
  • 3
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
linux 查看空闲节点,用qstat查PBS空闲节点(CPU)
weixin_42358261的博客
05-15 2075
嗯，$MAX为最大节点数，假设qstat得到的占用的节点信息为node123这样的形式。注意，source了LSF的一些环境变量后会有问题。#!/usr/bin/perluse strict;my $begin_node;my $end_node;my $node;my $USING=`qstat -an | grep node`;chomp($USING);my $MAX=384;sub usa...
pbsnodes查看计算节点格式化输出脚本
EngzSinger的博客
08-17 4607
自定义pbsnodes脚本背景torquepbsnodes存在的问题脚本编写目标脚本实现脚本运行的输出信息写在后面 背景 torque 集群系统可以看成一台计算机，允许多个用户同时使用，资源的分配成为不可回避的问题。开源软件torque为计算机集群资源管理提供了便利。 用户通过特定格式的输入文本（通常称为pbs文件）进行任务提交，系统根据用户的需求与现有计算资源，进行任务调度。用户在编写pbs文件时，往往想要预先知道计算资源使用情况，以进行合理的资源请求。torque也为用户提供了pbsnodes命令以查看
查看服务器任务运行节点,使用PBS命令在服务器集群运行软件
weixin_39697143的博客
07-31 6196
一．启动pbs服务1. 启动pbs服务端(主节点即为服务端)/etc/init.d/pbs_server start2. 启动客户端(主节点和其他节点都可以计算，因此都可以打开)/etc/init.d/pbs_mom start(注意：除start外，还可以status, restart, stop)3. 打开所有借点调度器/etc/init.d/maui.d ...
Flink：任务提交详细流程
SDKLHKJAS的博客
03-27 7476
文章目录 1.Flink多种提交方式对比 1.1 local模式 1.1.1 纯粹的local模式运行 1.1.2 local使用remote的方式运行 1.1.3 本地提交到remote集群 1.2 standalone模式 1.3 yarn模式 1.3.1 yarn-session 1.3.2 yarn-cluster 2.flink命令参数详解 3.flink on yarn作业提交详细流程...
【科普】集群基础和PBS任务管理常用命令
丑小鸭
02-08 6602
集群基础和PBS任务管理常用命令
qsub常用命令
热门推荐
kunxitoothache的博客
11-21 2万+
1、后台提交作业qsub 语法: qsub [-a date_time] [-A account_string] [-e path] [-h] [-I] [-j join] [-k keep] [-l resource_list] [-m mail_options] [-n Node_allocation_Method [-L v1,[v2,[v3,[v4]]]]] [-M user_list] [-N name] [-o path] [-p priority] [-q pool] [-r y|n
linux 查看空闲节点,简单地查看LSF空闲节点的perl脚本
weixin_42227109的博客
05-15 480
#!/usr/bin/perluse strict;my $begin_node;my $end_node;my $node;my $bash_env=`. /usr/local/lsf/conf/profile.lsf`;my $USING=`bjobs -u all | grep node | grep -v "^\$"`;chomp($USING);my $MAX=384;sub usage...
qsub 指定节点_qsub命令
weixin_39816448的博客
12-21 4164
用户通过qsub命令来向系统提交任务，有两种方式提交：脚本方式和命令行方式。(一般情况下，不允许root用户使用qsub命令提交作业)。下面先讲一下用这两种方式提交作业的过程。脚本方式提交用户将需要执行的程序或命令写入脚本中，再加入一些必要或者可选的语句，就可以通脚本方式提交。脚本提交比较方便，用户可以用最简单的文字编辑器(例如 vi)编写一个脚本，然后使用 qsub 命令提交该脚本，pbs 会按...
qsub_new_NEW_matlabGUI_
10-04
qsub 是 PBS（Portable Batch System）或 torque 资源管理系统的一部分，常用于在分布式计算环境中提交作业，特别是科学计算领域。 【描述】"qsub_new for function in matlab" 暗示了这个项目或代码更新是关于在 ...
PBS 用户指南-高性能计算集群.pdf
12-04
a) 查看空闲节点信息（提交作业前需要查看一下各队列节点空闲状况） b) 查看某个作业信息（提交作业后查看作业状态信息） c) 查看所有队列作业状态 （3）qdel 命令 qdel 命令用于删除已提交的作业，格式为： qdel...
将 MATLAB 函数提交到集群：在 gridengine/torque/PBS 集群上运行 MATLAB 函数-matlab开发
06-01
使用 qsub_submit_cm，可以将 MATLAB 计算提交到集群中。 输入在共享网络驱动器上传递，输出也在那里收集。 可选地，一旦计算完成，可以在提交主机上执行回调。 在...
PBS_Setup
03-29
这涉及到修改配置文件，例如`pbs_server.conf`和`pbs_mom.conf`，以指定网络设置、资源限制、作业队列和节点信息。 3. **初始化数据库**：PBS依赖于一个数据库来存储作业信息。在安装过程中，你可能需要初始化这个...
在服务器上提交WRF作业时的一些命令操作
05-22
在提交WRF作业时，需要编写 PBS 脚本文件，指定作业的各种参数，然后使用 qsub 命令提交作业。通过 qstat 命令，可以查询作业的状态信息。通过 qdel 命令，可以删除已提交的作业。通过 qhold 和 qrls 命令，可以挂起...
SGE qsub 命令 选项 笔记
weixin_30809333的博客
07-14 770
SGE qsub 命令 选项 笔记 jianshan.hu@swift.cn ChongQing, China qsub qsub命令用来向SGE提交批处理作业，SGE支持单或多节点作业。 qsub [ options ] [ command | -- [ command_args ]] 1.-@ optionfile (contains all valid options) 就是把...
PBS 使用指南
最新发布
Persus & Xie
11-24 2774
PBS 介绍及使用教程
服务器集群命令qsub（centos6.5 ）
weixin_44630244的博客
04-07 4742
将任务挂到计算节点方法： 第一步：查看服务器节点占用情况：输入pbsnodes，查看自己的服务器节点情况。 可以看到目前是在node02提交了三个任务（jobs）：895.coms-cluster.Rwlab、901.coms-cluster.Rwlab、902.coms-cluster.Rwlab 输入qstat可以简单查看任务情况： R：代表任务正在运行。 C：代表任务出错，已被中止，可以去输出文件中查看报错。 B：只用于任务向量，表示任务向量已经开始执行 E：任务在运行后退出
集群上作业提交系统LSF和PBS的使用与简介
werdery的博客
03-15 5161
集群上作业提交系统的使用与简介LSF作业提交系统bsub：作业提交通用方法bkill：删除作业bjobs：查看作业queues：查看队列信息PBS作业提交系统qsub：作业提交通用方法qdel：删除作业qstat：显示作业状态pbsnodes：显示集群中所有节点信息 LSF作业提交系统 bsub：作业提交 通用方法 #BSUB -n num #BSUB -l nodes=1:ppn=1 #BSUB...
qsub 指定节点_集群计算-qsub从节点提交作业时返回错误
weixin_39752788的博客
02-11 1264
我有一个在Torque / Maui系统下运行的复杂的fortran MPI应用程序. 当我运行我的应用程序时，它将产生巨大的唯一输出(？20 GB). 为了避免这种情况qsub 投递任务指定节点，我制作了一个RunJob脚本，该脚本将运行分为5部分，每个脚本产生的输出更小且更易于处理.当前，我的RunJob脚本在第一部分的末尾正确停止，并且还产生正确的输出. 但是，当它尝试重新启动时，会出现以下...
PBS指定节点文件自动部署
05-20
PBS是一个基于作业调度的分布式计算系统，它可以用来管理集群上的计算资源。如果你想要在PBS集群上部署节点文件，可以采用如下步骤： 1. 创建一个PBS作业文件，例如`job.sh`，内容如下： ``` #PBS -N job_name #PBS -l nodes=1:ppn=1 #PBS -l walltime=1:00:00 #PBS -j oe #PBS -o job_output.log # Copy node file to compute node scp /path/to/node_file $PBS_NODEFILE:/path/to/destination ``` 其中，`job_name`是你的作业名称，`nodes=1:ppn=1`表示申请一个节点和一个处理器，`walltime=1:00:00`表示作业运行时间为1小时，`job_output.log`是作业输出日志文件的名称。 2. 提交PBS作业： ``` qsub job.sh ``` 这将会将`job.sh`提交到PBS系统中，等待调度执行。 3. 查看作业输出日志文件： ``` cat job_output.log ``` 如果一切正常，你应该能够在日志文件中看到节点文件已经被成功拷贝到了计算节点上。 需要注意的是，以上步骤中需要将`/path/to/node_file`替换成你实际的节点文件路径，以及将`/path/to/destination`替换成你想要将节点文件拷贝到的目标路径。另外，你需要确保你的PBS集群中已经配置好了SSH密钥认证，否则你需要手动输入密码才能完成节点文件的拷贝。

“相关推荐”对你有帮助么？

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值