blast2go mysql_blast2go注释，报错“Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError: org/jdom/JDO...

最新推荐文章于 2021-07-30 16:50:14 发布
最新推荐文章于 2021-07-30 16:50:14 发布
阅读量207 收藏
点赞数
文章标签： blast2go mysql
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_42467224/article/details/113376448
版权

[root@iZ8vb8s8t9gi6cyewfy80bZ b2g4pipe]# java -jar blast2go.jar -in 122_cds_wanted.fa.tab -a -v -out 122_annot_result

Blast2GO Pipeline Version 2.5.0

--------------------------------------

Hash for resource ec2go_19072011.txt of type ec created. 4003 associations loaded.

Blast2GO build: 23092011

Change b2g-properties file to: b2gPipe.properties

Blast2go.version=2.5.0

Blast2GO can not reach the Internet

Blast2GO started (without GUI)

create new Project

set new Project

Hit description position set to: 5

Hit description filter set to:

GoWeight set to: 5.0

Exception in thread "main" java.lang.NoClassDefFoundError: org/jdom/JDOMException

at es.blast2go.prog.B2GAnnotPipe.(B2GAnnotPipe.java:199)

at es.blast2go.prog.B2GAnnotPipe.main(B2GAnnotPipe.java:102)

Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: org.jdom.JDOMException

at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:381)

at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:424)

at sun.misc.Launcher$AppClassLoader.loadClass(Launcher.java:338)

at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:357)

... 2 more

蔡喜喜
关注
java.lang.ClassNotFoundException：如何解决
m0_67402774的博客
05-17 5914
本文适用于当前面临java.lang.ClassNotFoundException挑战的Java初学者。 它将为您提供此常见Java异常的概述，这是一个示例Java程序，可支持您的学习过程和解决策略。 如果您对与更高级的类加载器相关的问题感兴趣，我建议您复习有关java.lang.NoClassDefFoundError的文章系列，因为这些Java异常密切相关。 java.lang.ClassNotFoundException：概述 根据Oracle文档，在类加载调用失败后，将使用其字符串名称引发Class
Blast2GO_windows_4_0.exe
09-06
对核酸，或者蛋白序列进行在线比对分析，然后针对于序列相似度或者保守性进行注释，功能富集
JDOMException错误解决办法
03-18
JDOMException错误解决办法 自己遇到过的
用jdom编写web程序时候的出错：java.lang.NoClassDefFoundError: org/jdom/JDOMException
ha_rry的博客
09-07 1022
上次在问答那里问了这个问题，结贴了，忘了把具体解决方法说清楚，所以在这里补充说明一下： 解决：要把jdom.jar包拷到jboss-4.2.3.GA\server\default\lib（jboss服务器里的路径）下，当然工程里也要有的...
java.lang.NoClassDefFoundError: org/jdom2/JDOMException
starinbrook的博客
08-04 6756
问题描述：org.springframework.web.util.NestedServletException: Handler processing failed; nested exception is java.lang.NoClassDefFoundError: org/jdom2/JDOMException注：jdom引的jar包是jdom-1.1.jar问题原因jar包版本不匹配解决办
JDom解析xml文件的java.lang.NoClassDefFoundError问题
轻口味的专栏
09-10 8784
java代码为： import java.io.IOException; import java.util.List; import org.jdom.Document; import org.jdom.Element; import org.jdom.JDOMException; import org.jdom.input.SAXBuilder; import org.jdom.xpath.X
blast2go centos mysql 5.7++ 安装报错ERROR 1819 (HY000) at line 4
qq_37329349的博客
09-05 347
1）解决导入数据mysql -uroot -p passwd <b2gdb.sql 报错ERROR 1819 (HY000) at line 4: Your password does not satisfy the current policy requirements mysql -uroot -p passwd 登陆mysql mysql> set global valida...
Dune-Blast.rar_site:www.pudn.com_unity3d_unity3d粒子_unity灰尘_灰尘
07-14
Unity3D 沙丘，灰尘粒子效果,开发环境得用unity3d引擎
blast.rar_blast_blast matlab_matlab blast
09-23
【标题】"blast.rar_blast_blast matlab_matlab blast" 暗示这是一个与“blast”相关的MATLAB仿真程序，可能涉及到爆炸力学或者冲击波分析。Blast通常指的是爆炸产生的冲击波，而在MATLAB环境下，这样的程序可能用于...
v-blast.rar_V BLAST _blast_v-blast
09-19
V-BLAST，全称为Vertical Bell Laboratories Layered Space-Time（贝尔实验室垂直分层空时编码），是一种先进的多输入多输出（MIMO）无线通信系统中的信号处理技术。在本压缩包中，包含的是与V-BLAST相关的MATLAB...
org.jdom.JDOMException: Error in building: C:\Tomcat 5.5\bin\WebRoot\WEB-INF\rep
zfjdoreen的专栏
11-19 348
错误：org.jdom.JDOMException: Error in building: C:\Tomcat 5.5\bin\WebRoot\WEB-INF\reportConfig.xml 原因：(系统找不到指定的路径。)我的是写死的，要改成配置完自动获取的路径 ...
jdom解析xml时候报java.lang.ClassNotFoundException: org.jdom.JDOMException
weixin_34015566的博客
07-07 954
使用jdom解析xml时候出现java.lang.ClassNotFoundException: org.jdom.JDOMException1.一个是导入包的版本不对如果你确定你导入包的版本没有问题，还是出现这个异常，jar文件也已经add了，那你看看你的项目lib下时候有你导入的jar，没有的话 就加上，问题就解决了。我就是这么解决的 转载于:https://b...
org.jdom.JDOMException: Error on line 1: Invalid encoding name "GBK"
Aikes Blog
12-22 1896
       在使用SAXBuilder解析GBK编码的XML时，有可能会提示编码无效之类的异常信息，如标题的异常日志。 解决方案：使用InputStreamReader存放指定编码XML流，用SAXBuilder的重载方法读取InputStreamReader即可   SAXBuilder sb = new SAXBuilder(false); InputStreamReader isr...
传统项目升级jdk1.7,问题汇总（二）报org.jdom.JDOMException
heart_mine的博客
03-01 3209
    报org.jdom.JDOMException: The element type "message" must be terminated by the matching  end-tag "</message>".: Error on line 8: The element type "message" must be terminated by the matching ...
解决java.lang.NoClassDefFoundError: org.jdom.Content
diyu8056的博客
11-18 690
报错：java.lang.NoClassDefFoundError:org.jdom.Content 解决办法： 更新lib目录下的jdom.jar 至最新版本。 转载于:https://www.cnblogs.com/ae6623/p/4416386.html
blast2go mysql_blast2go_blast2go中文使用说明_blast2GO
weixin_34554800的博客
01-20 1210
你可以选择在linux下或者windows下进行blast2go的架构，下面的教程适用于两种系统的安装。1.准备工作安装MySQL(请参考“MySQL-5.6.12.2下载与安装”)；下载并解压以下和文件(访问官网)：local_b2g_db.zip、b2g4pipe_v2.5.zip、gene_info.gz、gene2accession.gz、idmapping.tb.gz、go_201307...
BLAST2GO
huangliangbo的专栏
09-24 3711
记得在2年前用过blast2go，非常好用的序列注释和分析工具。可是后来重新装了几次JAVA的新版本之后电脑里的blast2go就挂了。最近重新把JAVA1.6装了回来，忍不住又想到blast2go。打开熟悉的主页上，猛击此处：  接着按需要选择下载：  然后就是启动…………久违的界面出现了……   以下内容转自：http://hi.baidu.com/in
Caused by: java.lang.ClassNotFoundException问题总结
qq_46411309的博客
07-30 1万+
Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: org.apache.flink.table.api.bridge.java.internal.BatchTableEnvironmentImpl 一、原因找不到BatchTableEnvironmentImpl 确实没有。 二、 解决 分析原因：下载的jar包里不存在方法实现，可能是因为网络原因；也有可能配的依赖就没有这个实现。 由于用到这个方法的程序是批处理，所以应该导入批处理依赖 <dependency
java.lang.ClassNotFoundException的解决方法：
热门推荐
anana125的博客
05-26 12万+
【转载于此】 java.lang.ClassNotFoundException的解决方法： 1.java运行环境的jdk版本比class文件的编译版本低了导致 2.class文件的访问权限或者所在目录的访问权限有问题,导致java无法读这个文件 3.jar包有错误,查看jar是否有漏或者重新导入jar包出现 java.lang.classnotfoundexception问题真的是很烦人，找资料解决问题弄了半天时间都没找到方法，走了许多的弯路，最终还是回到了原点找到了问题解决办法，费尽心机最终是解决了，但过
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/executables/LATEST/
最新发布
07-27
引用\[1\]:现在是ncbi-blast-2.12.0+版本，下载网址：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/。引用\[3\]:对于windows 2000/xp 用户，下载blast-2.2.18-ia32-win32.exe安装文件 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/LATEST/blast-2.2.18-ia32-win32.exe。 问题: ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/executables/LATEST/是什么? 回答: 抱歉，我没有找到提供的引用内容中关于ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/executables/LATEST/的信息。请注意，正确的网址是ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/LATEST/。 #### 引用[.reference_title] - *1* *2* [Alignment--本地blast使用详解1-数据库序列检索下载及比对](https://blog.csdn.net/qq_39859424/article/details/121575998)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^control_2,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item] - *3* [Blast本地化：window平台下blast软件的安装](https://blog.csdn.net/likelet/article/details/7245364)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^control_2,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item] [ .reference_list ]
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值