R语言如何实现文献计量——bibliometrix包的使用

已于 2023-09-17 15:54:29 修改
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分类专栏： 文献计量 文章标签： r语言 文献计量
于 2021-05-03 18:59:26 首次发布
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_42487488/article/details/116379324
版权

本文参考了R语言统计与绘图和走天涯徐小洋地理数据科学公众号的文章，膜拜大神！推荐大家关注！（两位老师请后台结一下广告费( • ̀ω•́ )✧）另外R语言统计与绘图公众号的文章来源于生态R学社 ，作者生态R学社。也推荐大家关注(▽)/★☆

上周组会的时候，老板提到让大家学习一下文献计量的方法，推荐了CiteSpace这个软件，我之前有试着用过这个软件，确实挺好用的，就是用起来不太顺手￣へ￣。

我想起之前在R语言统计与绘图公众号上看到了引自生态R学社的bibliometrix，快速实现文献计量分析的酷炫R包这篇文章，就想试一下，正好假期整理之前在微信浮窗的好文章（PS.有木有人和我一样，在微信更新浮窗无数量限制后，里面堆满了无数的文章），发现了徐老师的R语言文献计量分析初探还有文献计量从0到SCI（二）使用biblioshiny入手WOS文献计量，如获至宝，仔细阅读两篇文章之后，决定自己也记录一下这么酷炫的R包ヾ(ﾟ∀ﾟゞ)
bibliometrix包官网：https://www.bibliometrix.org/index.html

2023.9.17
没想到我最火的是这一篇博客，阅读量有20多万，反而WRF、CMAQ安装没啥人看，哈哈哈，果然学大气模型的人真是少。可是我后来不用R语言了，大家在评论区问的问题我也不会哎，所以大部分都没有回答，在这里和大家道歉。最近发现bibliometrix更新了，界面发生了一些变化，大家自行尝试吧

1 准备

1.1 安装bibliometrix包：

install.packages('bibliometrix', dependencies=TRUE)

借助R的shiny工具，叫做BiblioShiny，它的底层其实就是Bibliometrix包

通过以下方式调用这个shiny程序：

library(bibliometrix)
biblioshiny()

第一次启动Shiny程序，可能会由于缺少某些支持的包而报错，可以手动安装一下对应缺失的包。
[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-HuK3iyqT-1620038027799)(R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%AE%9E%E7%8E%B0%E6%96%87%E7%8C%AE%E8%AE%A1%E9%87%8F%E2%80%94%E2%80%94bibliometrix%E5%8C%85%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8%2035ce5500847b49bba3b168e419189273/Untitled.png)]

如上图就是缺少‘httpuv’这个名字的程辑包，安装就行：

install.packages("httpuv")

如此缺啥补啥，直到可以运行为止(=ﾟωﾟ)ﾉ

成功后会自动调用你的默认浏览器，出现如下工作界面：

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-MSEYEXOd-1620038027802)(R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%AE%9E%E7%8E%B0%E6%96%87%E7%8C%AE%E8%AE%A1%E9%87%8F%E2%80%94%E2%80%94bibliometrix%E5%8C%85%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8%2035ce5500847b49bba3b168e419189273/Untitled%201.png)]

1.2 文献数据准备

bibliometrix包官网给出了支持的文献搜索引擎和引文格式：

SourceURLFormatExtension
Web of Sciencehttps://www.webofknowledge.com/‘BibTeX’ ‘plaintext’ ’EndNote Desktop‘.bib’‘.txt’‘.ciw’
Scopushttps://www.scopus.com/‘BibTeX’ ‘CSV export’‘.bib’ ‘.txt’
Dimensionshttps://app.dimensions.ai/‘Bibliometric mapping’ ‘Excel’‘.csv’ ‘.xlsx’
The Lenshttps://lens.org/‘CSV export file’‘.csv’
PubMedhttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/‘PubMed export file’‘.txt’
Cochrane Libraryhttps://www.cochranelibrary.com/‘plaintext’‘.txt’

以Web of Science为例，我搜索的是我目前在做的Atmospheric carrying capacity，注意：这里记得数据库选择核心合集，不然后面导出时会有问题

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-gRoiMx7G-1620038027803)(R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%AE%9E%E7%8E%B0%E6%96%87%E7%8C%AE%E8%AE%A1%E9%87%8F%E2%80%94%E2%80%94bibliometrix%E5%8C%85%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8%2035ce5500847b49bba3b168e419189273/Untitled%202.png)]

然后导出为其他文件格式，这里记录内容要选择全纪录与引用的参考文献，支持的BibTeX、
plaintext和EndNote Desktop格式都可以选，我这里选择纯文本。
在这里插入图片描述

一次只能导出500条，我有774条记录，导出了两次，然后把这两个txt文件压缩为**.zip**格式（￣︶￣）

2 导入数据

在刚打开的浏览器中，选择Data→Import or load files，导入数据：

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-AiUQ4zJf-1620038027807)(R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%AE%9E%E7%8E%B0%E6%96%87%E7%8C%AE%E8%AE%A1%E9%87%8F%E2%80%94%E2%80%94bibliometrix%E5%8C%85%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8%2035ce5500847b49bba3b168e419189273/Untitled%204.png)]

导入成功如下ヾ(=･ω･=)o：

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-VkXBp31W-1620038027808)(R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%AE%9E%E7%8E%B0%E6%96%87%E7%8C%AE%E8%AE%A1%E9%87%8F%E2%80%94%E2%80%94bibliometrix%E5%8C%85%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8%2035ce5500847b49bba3b168e419189273/Untitled%205.png)]

3 开始分析

3.1 数据情况

3.1.1 年发文量

Dataset→Annual Scientific Production

统计年发文量
在这里插入图片描述

3.1.2 平均每年引用量

Dataset→Average Citations per Year

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-sQttNqzx-1620038027810)(R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%AE%9E%E7%8E%B0%E6%96%87%E7%8C%AE%E8%AE%A1%E9%87%8F%E2%80%94%E2%80%94bibliometrix%E5%8C%85%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8%2035ce5500847b49bba3b168e419189273/Untitled%207.png)]

3.1.3 三个字段之间关系的桑基图

Dataset→Three-Fields Plots

看三个字段之间关系桑基图

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-WylsBP8e-1620038027811)(R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%AE%9E%E7%8E%B0%E6%96%87%E7%8C%AE%E8%AE%A1%E9%87%8F%E2%80%94%E2%80%94bibliometrix%E5%8C%85%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8%2035ce5500847b49bba3b168e419189273/Untitled%208.png)]

3.2 文章来源分析

3.2.1 主要相关文章来源

Sources→Most Relevant Sources→Apply

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-c4djZtm2-1620038027811)(R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%AE%9E%E7%8E%B0%E6%96%87%E7%8C%AE%E8%AE%A1%E9%87%8F%E2%80%94%E2%80%94bibliometrix%E5%8C%85%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8%2035ce5500847b49bba3b168e419189273/Untitled%209.png)]

3.2.2 来源聚类分析

Sources→Source clustering through Bradford’s Law

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-1Isd7tt4-1620038027814)(R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%AE%9E%E7%8E%B0%E6%96%87%E7%8C%AE%E8%AE%A1%E9%87%8F%E2%80%94%E2%80%94bibliometrix%E5%8C%85%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8%2035ce5500847b49bba3b168e419189273/Untitled%2010.png)]

3.2.3 来源影响因子

Sources→Source Impact

支持H指数、G指数、M指数和总被引量

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-uDUUV4Ev-1620038027815)(R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%AE%9E%E7%8E%B0%E6%96%87%E7%8C%AE%E8%AE%A1%E9%87%8F%E2%80%94%E2%80%94bibliometrix%E5%8C%85%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8%2035ce5500847b49bba3b168e419189273/Untitled%2011.png)]

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-r1eoVbsZ-1620038027818)(R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%AE%9E%E7%8E%B0%E6%96%87%E7%8C%AE%E8%AE%A1%E9%87%8F%E2%80%94%E2%80%94bibliometrix%E5%8C%85%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8%2035ce5500847b49bba3b168e419189273/Untitled%2012.png)]

3.2.4 来源活跃度

Sources→Sources Dynamics
在这里插入图片描述

3.3 作者分析

3.3.1 最相关作者

Authors→Most Relevant Authors

在这里插入图片描述

3.3.2 作者不同时间发文情况

Authors→Authors’ Production over Time

通过这个可以显示不同作者发文情况，发文最多的前20名作者发文时间段和发文量，统计发文量前多少名的作者可以自由设置。

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-mINDBAON-1620038027824)(R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%AE%9E%E7%8E%B0%E6%96%87%E7%8C%AE%E8%AE%A1%E9%87%8F%E2%80%94%E2%80%94bibliometrix%E5%8C%85%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8%2035ce5500847b49bba3b168e419189273/Untitled%2015.png)]

3.3.3 相应的作者的国家

Authors→Corresponding Author’s Country

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-rbUM5tXa-1620038027825)(R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%AE%9E%E7%8E%B0%E6%96%87%E7%8C%AE%E8%AE%A1%E9%87%8F%E2%80%94%E2%80%94bibliometrix%E5%8C%85%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8%2035ce5500847b49bba3b168e419189273/Untitled%2016.png)]

3.3.4 发文机构比较

Authors→Most Relevant Affiliations

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-D1VM03hV-1620038027837)(R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%AE%9E%E7%8E%B0%E6%96%87%E7%8C%AE%E8%AE%A1%E9%87%8F%E2%80%94%E2%80%94bibliometrix%E5%8C%85%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8%2035ce5500847b49bba3b168e419189273/Untitled%2017.png)]

3.3.5 发文量国家比较

Authors→Country Scientific Production

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-NRQj5TCa-1620038027838)(R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%AE%9E%E7%8E%B0%E6%96%87%E7%8C%AE%E8%AE%A1%E9%87%8F%E2%80%94%E2%80%94bibliometrix%E5%8C%85%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8%2035ce5500847b49bba3b168e419189273/Untitled%2018.png)]

3.3.6 被引量国家比较

Authors→Most Cited Countries

[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-OoXqbXk5-1620038027839)(R%E8%AF%AD%E8%A8%80%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%AE%9E%E7%8E%B0%E6%96%87%E7%8C%AE%E8%AE%A1%E9%87%8F%E2%80%94%E2%80%94bibliometrix%E5%8C%85%E7%9A%84%E4%BD%BF%E7%94%A8%2035ce5500847b49bba3b168e419189273/Untitled%2019.png)]

3.4文章分析

3.4.1 最高被引文章

Documents→Most Global Cited Documents

在这里插入图片描述

3.4.2 Reference Spectroscopy

Documents→Reference Spectroscopy

在这里插入图片描述

3.4.3 词云分析

Documents→WordCloud

在这里插入图片描述

3.4.4 Word Dynamics

Documents→Word Dynamics

在这里插入图片描述

3.4.5 Trend Topics

Documents→Trend Topics

在这里插入图片描述

3.5 Coupling Map

在这里插入图片描述

3.6 热点和共现网络

3.6.1 共现网络

在这里插入图片描述

3.6.2 Thematic Map

在这里插入图片描述

3.6.3 Thematic Evolution

在这里插入图片描述

3.6.4 因子分析

在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述

3.7 时序图

在这里插入图片描述

3.8 Collaboration WorldMap

在这里插入图片描述

就是这样啦，我都试着弄了弄，挺好玩的(*･ω-q)，bibliometrix包真是够酷炫。

大家还有什么好玩的用法，可以评论呀ヾ(=･ω･=)o

下次见（￣︶￣）

陆詟水栗
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